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福建农林大学学报自然科学版第卷第期
JournalofFujianAgricultureandForestryUniversity(NaturalScienceEdition)20237
年月
15种蔷薇属matK基因的密码子偏好性分析
,,
黄长兵沈萍侯哲
(,215008)
苏州农业职业技术学院江苏苏州
:15,matK。:(1)GC、GC、GC
摘要基于种蔷薇属叶绿体全基因组图谱筛选其基因并对其密码子偏好性进行分析结果表明123
39.09、31.75、27.98,1GC,3GC,;
的平均值分别为密码子第位的含量最高第位的含量最低具有显著差异性有效密码子数与
3GC;(2)GCGC,;(3)matK
第位密码子的含量显著相关3与12的相关性不显著且密码子的偏好性受自然选择的影响基因的
,,matK;(4)29
有效密码子数低于预期值位于标准曲线的下方说明基因密码子的偏好性受到了选择的影响共计个密码子的
(RSCU)1,,27A/U,2G,matK
同义密码子相对使用度大于其中有个密码子均以结尾仅有个密码子以结尾说明基因的密
AU。RSCU3UGA(3.00)、UCU(2.08)、ACU(1.98)。
码子偏好以或者结尾较高的个密码子为
:matK;;;
关键词基因叶绿体基因组密码子偏好性选择与突变
中图分类号:S685.12
文献标识码:A
()
开放科学资源服务
文章编号:1671-5470(2023)04
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