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基因测序公共服务平台建设规
1范围
本文件规定了基因测序公共服务平台的实验室设计与建设、设备仪器管理、数据管理与信息安全、
人员培训与资质、记录与报告、客户服务与反馈、伦理遵守。
本文件适用于基因测序公共服务平台信息化建设工作。
2规范性引用文件
本文件没有规范性引用文件。
3术语和定义
下列术语和定义适用于本文件。
3.1
HEPA过滤器
高效空气过滤器主要用于捕集0.5m以上的颗粒灰尘及各种悬浮物。
3.2
BSL生物安全实验室
进行生物实验的国家或地区监督机构认证的具有一定生物安全标准的实验室。BSL可根据实验所涉
及的生物安全性别级分为BSL-1、BSL-2、BSL-3和BSL-4四级。BSL在分子生物学、医学、生物技术
等领域有广泛应用,保证了生物实验的安全性和有效性。
3.3
PCR聚合酶链式反应
聚合酶链式反应(PCR)是一种用于放大扩增特定的DNA片段的分子生物学技术,它可看作是生
物体外的特殊DNA复制,PCR的最大特点是能将微量的DNA大幅增加。
3.4
RFID射频识别
其原理为阅读器与标签之间进行非接触式的数据通信,达到识别目标的目的。
3.5
FASTQ格式
一种存储了生物序列(通常是核酸序列)以及相应的质量评价的文本格式。
1
3.6
FASTA格式
一种基于文本用于表示核酸序列或多肽序列的格式。其中核酸或氨基酸均以单个字母来表示,且允
许在序列前添加序列名及注释。该格式已成为生物信息学领域的一项标准。
3.7
reads测序片段
高通量测序技术产生的短核苷酸序列。常为几十到数百个碱基。
3.8
碱基
在化学中本是“碱性基团”的简称。在生物化学中又称核碱基、含氮碱基,是形成核苷的含氮化合
物,核苷又是核苷酸的组分。碱基、核苷和核苷酸等单体构成了核酸的基本构件。
3.9
信息化管理informationmanagement
利用信息技术手段,对实验室资源进行数字化管理,并实现设备自动化控制、数据采集、处理和分
析等功能的管理活动。
3.10
LIMS实验室信息管理系统laboratoryinformationmanagementsystem
通过获取、分析、报告、存储等手段,对实验室活动数据进行管理的计算机系统。
3.11
SOPs
标准作业程序(StandardOperatingProcedure,SOPs)是在有限时间与资源内,为了执行复杂的日常
事务所设计的内部程序。
4缩略语
下列缩略语适用于本文件。
IPS入侵防护系统(IntrusionPreventionSystem)
LIMS实验室信息管理系统(LaboratoryInformationManagementSystem)
PCR聚合酶链式反应(PolymeraseChainReaction)
RFID射频识别(RadioFrequencyIdentification)
5实验室设计与建设
5.1温度与湿度
5.1.1应保持恒定的温度(通常建议20-22°C),湿度应在40%-60%之间。
2
5.1.2样品接收与预处理区温度和湿度应适中。
5.2洁净度
5.2.1测序区域应设置为ISO5至ISO7级的洁净室。
5.2.2应使用HEPA过滤器确保空气质量。
5.3生物安全等级
5.3.1处理低至中等风险的微生物样本应达到BSL-2。
5.3.2处理潜在危险病原体需要更高生物安全级别的区域,应达到BSL-3。
5.4布局规划
5.4.1样品接收区:配备生物安全柜,用于样本的初步处理和分类。
5.4.2预处理区:包括核酸提取、PCR扩增等,应有良好的通风和清洁流程。
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