中国古老月季“月月粉”的叶绿体基因组密码子偏好性分析-侯哲.pdf

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侯哲等中国古老月季月月粉的叶绿体基因组密码子偏好性分析种子第卷第期

421

“”

中国古老月季月月粉的叶绿体基因组密码子偏好性分析

侯哲,李昂,黄长兵

(,)

苏州农业职业技术学院江苏苏州215008

:“”,。,

摘要本研究基于月月粉月季叶绿体全基因组图谱对其密码子偏好性进行分析结果表明月季的叶绿体基因组

,。,,,

总长为具有典型的四分体结构共筛选到条基因序列用于密码子偏好性分析的平均值

156591b49GCGCGC

p123

,,,,,;()

分别为47.7439.3829.16密码子第一位的GC含量最大第三位的最小具有明显的差异有效密码子数ENC与第三

;,;

位密码子的GC含量显著相关中性绘图结果说明GC与GC的相关性不显著且密码子的偏好性受自然选择的影响

312

,,,

及比值频数分布结果表明大多数基因的值低于预期值大多数基因位于区间外说

ENClotENCENC-0.050.05

-p~

;(),/

明大部分基因受到了突变的影响同义密码子相对使用度RSCU分析表明RSCU值大于1的密码子大多数以AU

,,、、、、

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