基因组学理论课 原核生物基因组.pptVIP

第八节原核生物的基因组原核生物基因组的研究现状原核生物基因组的基本特征几种原核生物基因组的比较分析微生物基因组研究的应用原核生物基因组的

研究现状微生物基因组计划的发展史1986年:美国DOE(DepartmentofEnergy)启动MGP(MicrobialGenomeProject)1994年: DOE项目转向与环境或能源相关与系统发生学相关具有潜在商业应用价值的微生物基因组计划1995年:《Science》发表第一株细菌－流感嗜血杆菌全基因组测序微生物几乎所有类别的病毒模式微生物极端环境微生物病原原核生物环境降解微生物开发前景的微生物其他已完成测序的

病原原核生物病原菌菌株数基因组大小(Mb)葡萄球菌（S.epidermidis;aureus）62.50-2.80肺炎链球菌（S.pneumoniae）32.10化脓性链球菌（S.pyogenes）61.90脑膜炎奈瑟菌（N.meningitidis）22.20致病性大肠杆菌（EHEC;UPEC）55.2-5.59志贺氏菌(S.flexneri)34.60沙门氏菌（S.typhietal）64.80霍乱弧菌（V.cholerae）24.0创伤弧菌(V.vulnificus)25.21原核生物基因组的

基本特征原核生物基因组的大小原核生物基因结构原核生物基因组的编码序列(CDS/ORF)原核生物染色体结构GC含量重复序列DNA链组成的非对称性1.原核生物基因组的大小--基因组较小的原核生物ProkaryocyteGenome(kb)ORFMycoplasmagenitaliumG-37B0580468Buchnerasp640583BuchneraaphidicolaSG641545Glossinabrevipalpis679621Ureaplasmaurealyticumserovar3B0751613MycoplasmapneumoniaeM129B0816677Mycoplasmapulmonis963782BorreliaburgdorferiB31B1910853TreponemapallidumNicholsB11,1381,041ChlamydiatrachomatisserovarD1,042894ChlamydiatrachomatisMoPnB11,069924ChlamydiapneumoniaeJ1381,2281,070Chlamyd