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蛋白质-蛋白质分子对接方法的研究进展

摘要蛋白质与蛋白质之间相互作用是后基因组时代重要的研究领域之一。分子对接方法是指两个或多个分子通过几何匹配和能量匹配相互识别的过程，为蛋白质-蛋白质相互作用的研究提供了有力的计算机模拟手段。本文介绍了分子对接的基本原理和蛋白质对接过程中需要考虑的因素，对影响对接效果的关键问题如分子柔性的考虑、侧链的处理及打分函数参数的设置等进行了论述；最后结合目前蛋白质分子对接方法中存在的问题及研究现状进行了展望。

关键词蛋白质-蛋白质相互作用；分子对接；分子柔性；打分函数

1引言

蛋白质是生命活动的主要承担者。现在人们所