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亚微型及复发性染色体拷贝数变异在复发性流产中的作用

【摘要】目的探讨复发性流产(ecuentspontaneousabotion,RSA)相

关的关键的染色体拷贝数变异(copynumbevaiation,CNV)区域、候选基

因及信号通路。方法基于2016年1月至2022年9月期间于郑州大学第三附属

医院检验医学科采用高通量测序技术进行流产组织CNV分析的1870例RSA患者

病例资料进行回顾性队列研究。根据孕妇流产年龄和孕周对病例进行分组，采用

x之检验或Fishe精确概率法分析染色体异常及CNV分布情况。通过基因富集分

析鉴定RSA相关CNV内基因功能、信号通路。结果1870例样本检出染色体异常

1001例(53.53%),其中93例(9.29%)检出140种CNVs,亚微型CNVs(＜10M

b)34种，片段^10MbCNVsl06种。在孕早期RSA(W12周)样本中检测到具有

统计学差异的亚微型致病性CNVs涉及lp36.33p36.23、2q37.3、4pl6.3、22qll.

21(x2=6.99,P=0.008),此外，16pll.2、Xpll.23pll.22微缺失首次在流产

病例中报道。显著复发的大型CNVs主要涉及18q22q23、4pl6pl5、9p24p22、8p

23p22、Xp22.3区域，所包含流产候选基因主要集中在PI3K-Akt及JAK-STAT信

号通路。结论罕见亚微型CNVs和复发性大型CNVs与孕早期RSA相关，G0和K

EGG数据库分析发现了潜在的流产候选基因及信号通路，为RSA的遗传学病因提

供了新信息。

【关键词】复发性流产；高通量测序分析；拷贝数变异

自然流产是指妊娠早期发生的胚胎或胎儿的丢失，通常孕周＜28周，胎儿体

质量＜1000g,是妊娠早期常见的并发症，发生率为10%5%[1-2]o复发性

流产(ecuentspontaneousabotion,RSA)被定义为两次或两次以上自然

流产，影响全球1%、2%的夫妇［1-3］。自然流产的原因包括遗传因素、内分泌

因素、免疫因素、易栓因素、母体因素、男方因素、环境因素等，其中遗传因素

是已知最常见的致病性原因，占流产病例的50%以上［4］。遗传因素包括染色

体数目异常、染色体结构异常、基因变异和表观遗传等［5］。其中拷贝数变异

(copynumbevaiation,CNV)是染色体结构异常最常见的形式之一，发生

率约为流产的2.7%［6］o

目前，针对流产物的遗传学诊断技术主要包括核型分析、染色体微阵列分析

(chomosomalmicoaayanalysis,CMA)和高通量测序(next-geneatio

nsequencing,NGS)等［7-8］。传统染色体核型分析技术可检测染色体数目

和大片段的结构变异，但其分辨率低，不能检出基因组小片段的CNV(10Mb)o

CMA可检测全基因组水平的染色体微重复和微缺失，但其依赖于探针杂交，无法

检测到探针未覆盖区域的CNV。近年来，基于NGS平台的CNV-seq技术，由于其

对样本要求低、成本低、通量高、分辨率高，且能额外发现芯片探针无法覆盖的

CNV而逐渐应用于自然流产物的遗传学诊断。本文聚焦于通过CNV-seq技术检出

的10Mb以下的亚微型CNV和大型复发性CNV的分析。

本研究通过对RSA患者的流产组织样本进行CNV-seq检测，分析CNV在流产

中的检出情况以及CNV中潜在的自然流产相关候选基因，并通过基因富集分析鉴

定基因功能和信号通路，以确定与流产相关的关键CNV区域、候选基因及信号通

路。

资料与方法

一、研究对象

本研究为回顾性队列研究。研究对象为2016年1月至2022年9月期间在郑

州大学第三附属医院就诊确诊为复发性胚胎停育并接受流产组织CNV分析的患

者。纳入标准：①孕妇发生两次或两次以上自然流产；②流产前B超均提示胚胎

停止发育；③流产样本通过NGS方法进行染色体拷贝数变异分析。排除标准：①

孕期宫内感染史、有毒有害物质接触史；②B超指标异常；③遗传病家族史。根

据孕妇流产年龄（＜30岁