基于云计算与弹性计算的基因组预测分析系统.docxVIP

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基于云计算与弹性计算的基因组预测分析系统

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么贺贵高云燕姜驿王金豹唐友

摘?要：该项目以云计算与弹性计算为实践方法，基于多种平台架构，对基因组预测分析系统进行开发设计。采用MySQL数据库，通过Apache构建平台，使用阿里云计算推出的弹性计算云服务器，运用JavaWeb来实现基因组预测分析功能。项目遵循软件工程生命周期，从需求分析、数据库设计等多方面进行详细阐述，全面介绍了基因组预测分析的全过程，具有计算准确度高，页面操作难度低，结果可视化等多个优点，能够为用户提供良好的云计算服务。

关键词：云计算;弹性计算;WebServer架构

：TP311.52;R394???：A：2096-4706（2020）23-0076-04

GenomePredictionandAnalysisSystemBasedonCloudComputingand

ElasticComputing

MOHegui1，GAOYunyan2，JIANGYi1，WANGJinbao1，TANGYou1，3

（1.ElectricalandInformationEngineeringCollege，JilinAgriculturalScienceandTechnologyUniversity，Jilin?132101，China;

2.EconomicandManagementSchool，JilinAgriculturalScienceandTechnologyUniversity，Jilin?132101，China;

3.SmartAgriculturalEngineeringResearchCenter，JilinAgriculturalScienceandTechnologyUniversity，Jilin?132101，China）

Abstract：Thisprojecttakescloudcomputingandelasticcomputingasthepracticalmethods，anddevelopsanddesignsthegenomepredictionanalysissystembasedonvariousplatformarchitectures.TheMySQLdatabaseisusedtobuildtheplatformthroughApache，theelasticcomputingcloudserverlaunchedbyAlibabacloudcomputingisusedtorealizethefunctionofgenomepredictionandanalysisbyusingJavaWeb.Theprojectfollowsthelifecycleofsoftwareengineering，elaboratesontherequirementsanalysis，databasedesignandotheraspects，andcomprehensivelyintroducesthewholeprocessofgenomepredictionandanalysis.Ithasmanyadvantages，suchashighaccuracyofcalculation，lowdifficultyofpageoperation，andvisualizationofresults.Itcanprovideuserswithgoodcloudcomputingservices.

Keywords：cloudcomputing;elasticcomputing;WebServerarchitecture

0?引?言

近几年，信息技术与生物领域相融合的研究日趋丰富，高通量测序技术（RNA-set）迅速发展，为海量数据的计算提供了可能。云计算与基因预测整合了软件与硬件资源，并以易用、可统计使用量的服务方式向公众提供分布式、并行计算方案[1]。生物学信息内容研讨中常见辅助工具有基因组裁剪、短二阶对比与剖析[2]、无参考基因组的转录组剖析、有参考基因组的转录组剖析、监控突变基因、基因预估、基因组注解、吸附剖析与基因同源性剖析等等[3]。目前这类生物计算的相关软件种类繁多，技术也日趋多样化。在实际应用中，为了将计算时间最小化，通常会采用并行集群系统[4]。

本文基于对基因组预