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基于基因表达综合数据库与中医传承辅助系统分析气虚血瘀型脑梗死的中医药防治策略
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宋洋杨仁义周德生傅馨莹刘利娟颜思阳陆展辉陈瑶
摘要目的:利用GEO芯片数据及中医传承辅助系统,获取气虚血瘀型脑梗死的差异基因及中医药防治方剂,并分析其作用机制,为气虚血瘀型脑梗死的中医药防治策略提供理论依据。方法:采用生物信息学、数据挖掘、网络药理学等多学科交叉方法,对气虚血瘀型脑梗死的中医药防治策略进行探讨。整合基因表达综合数据库(GEO)、中医药整合药理学研究平台(TCMIP)、GeneCards、PubChem、中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、STRING、WebGestalt、DAVID多数据库资源及Cytoscape、R语言软件工具,对气虚血瘀型脑梗死疾病靶点、中药靶点进行筛选,从蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络、基因本体(GO)及京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集的角度,对中医传承辅助系统数据挖掘获取的气虚血瘀型脑梗死基础方的作用机制进行探讨。结果:获取2542个气虚血瘀型脑梗死疾病靶点,其中差异基因结果显示HIF1A、PIK3CA、PIK3R1、TP53、NFKB1、HSP90AA1、CREBBP、CASP8、IL6、TNF、ITGB等表達上调,APOE、IGF1、CXCL5、SRC、ADCY5、PTGS2等表达下调,可作为疾病诊断治疗的潜在靶点。58首气虚血瘀型脑梗死方剂的用药规律,包括频次、关联及新方组合,获得气虚血瘀型脑梗死基础方剂,由黄芪、川芎、当归、地龙、党参、西洋参、白术、桃仁、赤芍、枳实10味中药组成,具有益气活血、行气化痰的功效,其作用机制可能与调控差异基因以多组分、多功能、多途径的方式,主要通过HIF-1、TNF、NF-kappaB、Apoptosis、PI3K-AKT等通路发挥作用。结论:气虚血瘀型脑梗死的中医药防治当以差异基因靶点为中心,筛选出临床基础方,根据临床辨证施治加减中药,同时可采用多学科交叉方法对气虚血瘀型脑梗死的方剂从多组分、多途径、多靶点层面进行临床与实验验证。本研究为中医药治疗气虚血瘀型脑梗死提供了方法理论上的指导,对推动中医药现代化具有重要意义。
关键词气虚血瘀;脑梗死;基因表达综合数据库;差异基因;中医传承辅助系统;网络药理学
AnalysisofTraditionalChineseMedicinePreventionandTreatmentStrategyofCerebralInfarctionofQiDeficiencyandBloodStasisBasedonGEODataandTCMInheritanceAuxiliarySystem
SONGYang1,YANGRenyi2,ZHOUDesheng1,FUXinying2,LIULijuan1,YANSiyang2,LUZhanhui2,CHENYao1
(1TheFirstAffiliatedHospitalofHunanUniversityofTraditionalChineseMedicine,Hunan,Changsha410007,China;2HunanUniversityofTraditionalChineseMedicine,Hunan,Changsha410208,China)
AbstractObjective:TouseGEOchipdataandtraditionalChinesemedicineinheritanceauxiliarysystemtoobtainthedifferentialgenesandtraditionalChinesemedicinepreventionandtreatmentprescriptionsofcerebralinfarctionofqideficiencyandbloodstasistype,andtoanalyzeitsmechanism,soastoprovidetheoreticalbasisforthepreventionandtreatmentstrategyoftraditionalChinesemedicineofqideficiencyandbloodstasistypeofcerebralinfarction.Methods:ThepreventionandtreatmentstrategyoftraditionalChinesemedic
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