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关于连接反应的心得--第1页
关于连接反应的心得
关于连接反应的心得
关于连接反应的心得
最近我在进行转基因载体构建,其中关键步骤包括酶切、酶切片
段回收、载体与外源基因A的连接、转化以及重组子的鉴定。我的工
作首先是将基因A(5kb)连接到表达载体B(22kb),然后还要将标
记基因(6-8kb)连到带A的载体上,这其中包括粘末端连接、平端
连接、同尾(相同粘性突出端)连接以及双酶切定向连接。但是我在
进行A和B连接时废了1个多月,经高人指点后才连接成功,之后几
步连接也相当顺利,经过无数次失败后终于成功,欣喜之余将一点实
验心得写下来,供大家参考。
1.关于不同连接方式的效率:
根据载体自连的可能性大小,可以总结出不同连接方式的效率高
低,双酶切定向连接粘末端连接=同尾连接平端连接。如果将载体
双酶切后的非目的片段去除干净,定向连接将很难自连,而平端连接
最容易造成载体自连
2.关于载体和insert的酶切处理:
这是连接反应中最关键的问题之一。我做的第一步连接失败的原
因在于insert(基因A)的处理,基因A是从一个中间载体(两个SalI
位点)用SalI酶切下来,之后用Bio101(USA)的GELextraction
kit(Glassmilk回收)回收,然后与经XhoI(与SalI同尾)酶切的载
体连接,重复了十几次,一直很失败,后来才听人说Glassmilk回收
较大片段时容易造成片段降解,同时有可能破坏粘末端,可能国内大
部分胶回收KIT回收2kb以上片段时,都会有这种情况。于是我采用
此人建议在酶切中间载体时,除加SalI外,还选用中间载体上非目的
片段中特有的酶(基因A中千万不能含此酶,选用该酶可以有效防止
载体自连)进行酶切,酶切后不回收只是65C保温15分钟使内切酶变
性即进行连接,结果从22个克隆中筛得3个重组子。尝到甜头后,我
在后面的双酶切定向连接中也采用这种处理方法,即对载体进行双酶
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切时,选用非目的片段中特有的1-2个酶同时进行酶切,insert也是
如此处理,基本上每次连接都取得了好的结果,这种酶切方法最适于
双酶切定向连接。采用这种酶切方法,可以减少切胶回收,。至于酶
切后处理,我对照了65C保温15分钟直接连接与酚仿抽提后乙醇沉淀
两种处理方法,效果无明显差异。而前者省时省力省钱,因此我倾向
采用前者
3.关于载体和insert的摩尔比:这是连接反应中另外一个关键问
题。一般连接反应的载体和insert的摩尔比为1:3-10,增加insert
的量主要是减少载体自连,从而提高载体和insert的连接效率。但是
这个比例并非总是如此,关键看载体和insert哪个更容易自连,如果
载体和insert都经上述酶切方法处理,1:1连接即可;如果载体相对
容易自连,则应增加insert的
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