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以下是简单整理的东西
产前实验流程解析
.血浆分离.DNA提取.文库构建
主要内容:
血浆分离
实验流程:
1.预冷离心机。
2.将全血按同的医院代码分类,记录各医院全血的流水号,然后置于
4℃冰箱暂存。
3.待离心机预冷至4℃,将全血样品置于离心机中(离心时注意严格
配平),1600g离心10min。此过程可准备实验需要的中转管和最终管。
4.离心完成后吸取上清液平均分到2个或多个已编号的2.0mlEP管中,
注意核对样本编号及能吸到白细胞和红细胞,此过程需要在冰盒上操
作,并严格对号。
5.将上一步得到的血浆置于预先冷却至4℃的离心机,16000g离心
10min,离心后将上清转入新的已编号及贴好血浆条码2.0mLEP管中,
至少保证前3管体积为600ul,此过程同样需要在冰盒上操作,并严
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格对号。
6.分离完成后制作产前血浆分离反馈表.
注意事项
1.全血样本必需在离体8小时内分离完血浆。
2.必需保证样本在低温条件下离心,离心时应严格配平。
3.开启EP管盖时,注意能碰到EP管内盖。
4.血浆分离结束后,若短期内无法将样本送往配送组入库,必需将样
本置于-20℃冰箱中暂存。
5.离心机使用结束后应及时关掉电源。
6.吸取上清时慢吸慢打,吸到中间层的白细胞,若吸到白细胞应将全
血重新离心。
7.去DNA清洗液为酸性溶液,能用于清洗离心机转子,以免腐蚀转子。
8.实验所用EP管架需定期用1%盐酸浸泡过夜后洗净再使用。
9.若实验室未配制DNA清洗液,可用10%次氯酸钠代替,使用方法
同DNA清洗液。
问题
问:第一步离心后,从采血管内吸取血浆时,吸到白细胞和红
细胞,怎么处理?
答:重新离心5-10min
问:为什么要严格要求第一步分离血浆时能吸到中间层的白细胞和红
细胞?
答:由于第二步高速离心会使得有核细胞破裂,造成人体基因组DNA
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的释放,母体DNA背景过大,从而影响实验结果。
问:为什么无创产前基因检测样品类型是血浆而选用血清?
答:血清是添加抗凝剂而通过自体纤维蛋白原和凝血因子分离出来的
上清液,血浆则是添加抗凝剂后析出的上清液。血清在血凝块收缩时
会导致细胞内DNA的释放,导致母体背景DNA过大,影响实验结果,
而血浆内基质更稳定,可保存时间更长。
DNA提取
原理:
在高盐低pH的条件下通过硅胶膜特异吸附,将裂解液中的DNA吸附
到硅胶膜上,去除杂质后用低盐洗脱液洗脱得到吸附在膜上的DNA。
天根试剂盒DNA提取简易流程
600μL血浆+10μL蛋白酶K
加入600μLGBmix(GB:carrierRNA=1mL:10μL),混匀
56℃水浴10min,取出后冷却5min,短暂离心
加入300μL冷冻无水乙醇,轻轻颠倒混匀
将混合液转入提取柱中,8000rpm离心30s
弃滤液,加入500μLGD,8000rpm离心30s
弃滤液,加入500μLPW,8000rpm离心30s(重复1次)
弃滤液,12000rpm离心2min
将提取柱放在1.5mL离心管上晾干3min
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