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2024-09-20 发布于北京
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GenomecomponentanalysiscontainpredictionofncRNA,CRISPR,

TandemRepeat,Genomicsisland,Prophage.DdatabaseannotationcontainsofCAZY

database.AndEscherichiacoliwithbelongingtothegenusEscherichia,whichbelongs

torelatedspecies,strainscanbeobtainedbetweenthestructuralgenomicvariation

(chromosomalrearrangements,etc.)occurintheevolutionaryprocessbyco-linear

analysis,suchashavingasimilarfunctiongeneclustersvaryindifferentlocationssuch

strains.Jbrowsecanvisualizethedatashowsomeresultsoftheaboveanalysis.For

exampletheremaybearRNA,crispr,Tandemrepeat,Genomicsisland,prophagein

therelativepositionofthereferencesequence;CAZYmaybepresentintheprotein

databaseandannotationinformation;homologousEscherichiacoliandbacteriathan

situation。

Keywords：Genomecomponentanalysis；cazydatabaseannotation；syntenyanalysis;

JBrowse

1绪论…………………7

2.组分分析………….7

2.1ncRNA………………….…….7

2.2crispr预测……………7

2.3tandem_repeat预测…………………….9

2.4genomicisland预测…………

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