NIPT综述ppt课件近年原文.ppt

NIPT综述*NIPT以后能查什么！*目录染色体非整倍体亚染色体异常单基因遗传病胎儿全基因组的构建*染色体非整倍体（一）NIPT行业进展欧美等国在NIPT纳入国家级医保系统方面的进展2015年7月，瑞士首次将NIPT纳入国家级健康保险系统①。英、美、德、日、法、荷兰、新西兰、比利时等许多国家均已开始进行NIPT普及的评估①。2016年开始，我国多个地区陆续表示，建议将NIPT纳入医保。*染色体非整倍体（二）NIPT纳入医保势在必行纳入医保的前提条件：NIPT纳入医保是医疗保障政策的大势所趋，是行业发展的必然结果！驱动力政策保障质量保障形成大规模的社会需求“近似于诊断的高精准度筛查技术”在临床应用中已有对应的政策规范*仪器试剂耗材检测服务分析软件染色体非整倍体（三）NIPT市场布局*染色体非整倍体（四）

NIPT技术规范限制条件解读*

染色体非整倍体（五）

胎儿游离DNA浓度8种检测方法①方法优势不足1Y染色体估算法简单；准确不适用于女胎2基于SNP的胎儿特异SNP位点法直接；准确父亲DNA有时获取存在困难3基于SNP的深度靶向测序法仅需检测母体血浆DNA；准确需要深度测序（120X）4基于SNP的低深度测序只需要对母体血浆DNA低深度测序；准确母亲基因分型需要额外成本；不同的基因分型和测序平台需要重新校准曲线5基于cfDNA片段数目只需要对母体血浆进行测序；单端测序；易于整合到现有的NIPT流程中需要大样本来建立网络模型；当cfDNA浓度低于5%时准确性差6基于甲基化标记的方法准确测序前用亚硫酸盐或者对甲基化敏感的酶切处理可能降低准确性；甲基化测序成本较高7基于cfDNA长度差异只需要对母体血浆进行低深度测序；易于整合到现有的NIPT流程中准确性一般；双端测序增加成本8基于核小体印迹法测序深度低准确性差；在构建模型时需要进行深度测序*亚染色体异常（一）

检测的必要性常染色体重复或缺失的片段较大的话对于胚胎是致死性的，如果片段较小（一般20Mb以内），胎儿存活，大部分表现为多发畸形、发育迟缓、智力低下等综合征。绝大多数微缺失综合征（5Mb以内）在宫内发育期间基本无异常表现。微缺失微重复疾病目前已发现近300种，合并发病率近1/600。其遗传特点常为显性发病，以新发突变为主(约占85%～95%)，家族性遗传约占5%～10%。最佳防控阶段：二级预防*技术范围应用优点缺点核型分析染色体组G显带染色体核型分析可以检测出染色体平衡易位、倒位灵敏度低（3M）、耗时长、FISH目标片段特定目标筛选后的验证灵敏度高、耗时短、可检测平衡易位、倒位成本高、通量低、需要特异性探针、不适合大面积筛查BoBs目标片段特定目标技术简单、成本低、耗时短通量较低、需要特异性探针、不适合大面积筛查qPCR目标片段特定目标简单快速、廉价易行准确度低、通量低、MLPA目标片段特定目标技术简单、耗时短成本较高、技术复杂、通量低CMA染色体组UPD单亲二倍体LOH杂合缺失分辨率高、自动化高最主流的检测方法成本高、aCGH不能检测UPD，平衡易位SNP可以NIPT-plus染色体组UPD不行LOH可以非侵入式成本高、后期分析难度高亚染色体异常（二）

常见检测技术及优缺点*亚染色体异常（三）

亚染色体异常的产前筛查与诊断方式针对特定目标的检测方式：FISH、BoBs全染色体组筛查方式：：CMA+FISH；NIPT-plus+FISHNIPT-plus+FISH优缺点：非侵入分辨率高数据处理难度大*应用进展ISPD在2015年8月更新了NIPT的临床指导意见。明确指出NIPT可以针对研究清楚的染色体微缺失/微重复综合征进行检测。2017年初，吉林省出台了NIPT-plus的地方标准。改进措施提高cffDNA浓度增加测序深度改进生物信息学分析方法亚染色体异常（四）

NIPT-plus的应用进展及改进措施

**五大类遗传病中，病种最多的当属单基因病。截止到17年初，OMIM正式收录的超过8000多种。遗传机制明确的有5000余种，一部分发病率高，危害性大的常见单基因病已能进行临床基因诊断。例如：遗传性耳聋、杜氏进行性肌营养不良（DMD）、α和β地中海贫血、先天性肾上腺皮质增生症（CAH）、枫糖尿病（MSUD）、血友病、镰状细胞病、威尔逊病...单基因遗传病（一）发病情况*单基因遗传病（二）分析方法致病机理明确的单基因遗传病实现临床应用的基