多组学大数据共享平台研究进展.pdf

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第35卷第12期生命科学Vol.35,No.12

2023年12月ChineseBulletinofLifeSciencesDec.,2023

DOI:10.13376/j.cbls/2023169

文章编号:1004-0374(2023)12-1553-08

李亦学,研究员,博士生导师。现为广州实验室研究员、国家生物数据中

心体系粤港澳节点平台首席科学家兼主任,中国生物信息学会(筹)副理事长,

上海生物信息学会理事长,上海交通大学教授,复旦大学遗传学教育部协同创新

中心前沿生物技术部主任。主要研究领域为生物信息学、基因组学、精准医学、

人工智能、大数据、知识图谱等。曾任国家“十五”863计划生物和农业技术领

域生物信息技术主题专家组组长,国家“十一五”863计划生物医药技术领域专

家组专家;国家蛋白质科学研究重大专项“模式生物和细胞等功能系统的系统生

物学研究”“代谢生理活动与病理过程中信号转导网络的系统生物学研究”两任

专项项目首席科学家。获得上海市自然科学奖一等奖、二等奖,教育部自然科学

奖等,并荣获全国五一国际劳动奖章,上海市劳动模范,第一批上海市“科教兴

市领军人才”等。

张国庆,研究员,博士生导师。现任中国科学院上海营养与健康研究所生

物医学大数据中心副主任,中国科学院计算生物学重点实验室副主任,上海生物

医学大数据工程技术研究中心执行主任,中国遗传学会生物大数据专业委员会委

员,中国医药生物技术协会生物医学信息技术分会委员。主要研究方向是生物医

学数据库与知识库,包括精准医学、自然及疾病人群队列、人类表型组、环境及

病原及人体微生物组等领域的数据库和知识库的研发,致力于多维生命组学数

据、文献数据、健康与医疗等真实世界数据的集成与管理,以及以知识库为代表

的数据科学关键技术研究。

多组学大数据共享平台研究进展

1#1#1,2*1*

凌鋆超,曹瑞芳,李亦学,张国庆

(1中国科学院上海营养与健康研究所,生物医学大数据中心,上海200032;2广州实验室,广州510005)

摘要:高通量检测技术的快速发展催生了海量的多组学数据,数据驱动型研究规模正逐步超越传统假设

型研究。不同层次组学数据的组合,通过对系统生物学和疾病发展更深入和全面的解读,持续改变生物医

学研究方式。同时,多组学数据庞大的数据规模、异质的数据特性,以及强烈的数据共享内源性需求,都

推动组学数据向规模化、平台化、标准化共享的方向发展。该文首先介绍了代表性的多组学平台和各组学

数据的特点,接着以多维组学数据百科全书NODE为例,从多组学数据融合和多组学数据安全共享两方面

对相应的方法和技术进行了细致的阐述,并展望了多组学数据平台未来的发展方向。

关键词:多组学;大数据;数据平台;数据共享

A

中图分类号:Q811.4文献标志码:

收稿日期:2023-03-11;修回日期:2023-10-30

基金项目:国家重点研发计划(2018YFC2000205)

*通信作者:E-mail:gqzhang@;Tel:

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