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计算机化学

;一.计算机辅助分子设计

I.构效关系(QSAR/QSPR)研究

II.全新药物设计

III.组合化学与药物设计

二.有机化合物结构解析

专家系统

三.计算机辅助合成

四.新的化学计量学方法;一.计算机辅助分子设计

(Computer-aidedmoleculardesign)

;I.构效关系研究

(QuantitativeStructure-Activity/PropertyRelationshipstudy,QSAR/QSPR)

基本假设:

?化合物的结构与其活性/性质是

相关的;

?化合物的结构与其活性/性质不

是一一对应的.;分子结构图;Y=f(x1,x2,…,xm)

式中:

Y为活性/性质;

x1,x2,…,xm为结构特征。

;y(体重)=f(身高)

体重:y

身高:x

Y(体重)=f(身高,腰围)

体重:y

身高:x1,腰围:x2;结构图输入;;特征的主要类型:

(1)拓扑类参数:如图论指数

(即拓扑指数),结构片断等;

(2)几何类参数:如键长,键角,

二面角等;

(3)电子类参:如,量化参数等;

(4)物理化学类参数:如疏水性参

数,超热力学参数等。

;二维构效关系研究

(2DQSAR/QSPR)

不主要运用3D结构特征

;

在本研究工作中,苯胺类化合物的生物毒性是该化合物对小鼠的口服毒性半致死量LD50,即引起半数受试小鼠死亡所需的苯胺类化合物的剂量。实验数据来源于美国国家职业安全与卫生所编制发行的RTECS(RegistoryofToxicEffectsofChemicalSubstances)。

苯胺类化合物

的母体结构为:

*XuLuetal.,ScienceinChina(SeriesB),2000,43,129-136;Table1Substitutedamino-benzensandtheirtoxicity

No. R1 R2 R3 R4 R5-log(LD50)--log(LD50)diff.(obs) (cal)1 Me H H H H -2.826 -2.854 0.028

2 H Me H H H -2.653 -2.697 0.044

3 H H Me H H -2.817 -2.778 -0.039

4 Et H H H H -3.100 -3.084 -0.016

5 isoprop H H H H -3.072 -3.067 -0.005

6 Me Me H H H -2.970 -2.980 0.010

7 Me H Me H H -3.113 -3.097 -0.016

8 Me H H Me H -2.924 -2.919 -0.005

9 Me H H H Me -2.924 -2.917 -0.007

10 H Me Me H H -2.909 -2.915 0.006

11 H Me H Me H -2.849 -2.834 -0.015

12 Me H H H Et -3.072 -3.106 0.034

13 Et H H H Et -3.255 -3.276 0.021

14 Me H Me H Me -2.871 -2.903 0.032

;15 H CF3 H H H -2.681 -2.685 0.004

16 H Cl H H H -2.408 -2.419

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