第六章-代谢网络的定量分析.ppt

第六章代谢网络的定量分析;复杂的网络代谢理论为系统研究微;用代谢网络定量分析的方法来解释;代谢网络途径分析从简单地分析代;途径分析在基因识别和生物技术上;代谢网络应用理论基础显然，利用;ER模型建立在随机过程上，即一;研究者发现，线的神经网络就是一;代谢网络研究的主要研究成果近几;3、高度连接的是底物而很少连接;7、如果一种底物(节点)由于催;蛋白质之间的互作网研究表明，自;只有～18.7%的酵母基因（～;由于代谢网络结构是一种并行的结;一、代谢网络定量分析的研究意义;如果这些解释使用的是定性的方法;近几年代谢网络定量分析法发展迅;鉴于代谢网络定量分析在代谢工程;二、代谢网络定量分析的;㈠代谢控制分析（MCA）的基本;随着对复杂代谢现象认识的需要和;基本理论MCA的基本研究对象;根据以上概念，在假设代谢系统是;根据MCA理论,代谢控制是细胞;代谢控制分析定义了一些重要的表;通过对其进行比较即可找到限制;控制系数是指在生理条件(即;上式中如果A代表指定的代谢;弹性系数是指在一个与代谢系统;而总和原理与连通性原理;局限性⑴控制系;②控制系数是否可以作为代;⑵当涉及MCA的连通性;这是MCA理论应用的“;⑶MCA在指导代谢工程方;此外，以MCA为设计基础的;通常的做法是考虑解除反馈抑;应用MCA;随着理论研究的深入发展，代谢控;MCA在研究复杂代谢网络中的进;代谢途径中的限速步骤MCA的研;㈡代谢通量分析（MFA）的基;代谢通量分析（MFA）是代谢;基本理论代谢通量分析是根据代谢;假设细胞内的中间代谢物均处于准;应用①计算细胞内部通量;应用代谢通量法分析黄原胶发酵实;其中产胶期黄单胞菌内部代谢通;无标题;矩阵A的秩为6，须确定的;由出口气体组成可以测得氧消耗速;在150L规模的发酵罐中，产胶;代谢网络的自由度为2，只需;r0=0.167rs，r;无标题;按文献取P=0.38，a=;如果采用一些手段提高合成路径中;如果改变操作条件，则细胞产胶和;呼吸商RQ=SCER/;通过rs、rp根据通量模型;一是数据本身的误差，间歇和流;二是氧限制的存在，黄原胶发酵;㈢生化系统理论（BST）的基本;基本理论生化系统理论???BST）;求解此约束条件最优化问题即可;应用生化系统理论以线性优化程序;Papoutsakis和M;Torres等人构建了数学模;㈣控制论模型（CM）的基本理;基本理论现代控制理论以状态变;其观点是把微生物本身看作是一位;这种理解已被用于描述试验的调节;在以上理论的基础上，Varne;Varner等人用这个模型描;㈤途径分析的基本理论及应用;基本理论代谢途径的确定可以提供;这些原理包括最近提出的元素模;途径分析在基因识别和生物;途径分析的必威体育精装版发展为凸分析在;Liao等发现代谢物产率最终;Seressiotis等人应;利用途径工程改造阿维链霉菌生产;阿维链霉菌发酵产生8个组分;日本的Ikeda和mur;通过将K2021和K20;从阿维菌素基本结构出发，对某些;Ikeda等在研究aveD;中国农业大学的陈芝等采用破;野生型阿维链霉菌合成的B1：;Stutzman-Engwal;他们构建这两个基因替换质粒载体;三、展望代谢分析方法的发展;这些方法的出现、发展、完善，再;Content代谢物流分析细;细胞代谢流的测定细胞内外代谢;代谢流分析定义是一种计算流经各;代谢物流分析的意义代谢物流分析;有关代谢分析的研究方法1.详细;代谢流的研究任务对已知途径而言;代谢流与代谢工程的关系代谢工程;代谢物流分析应用（１）定量各途;（４）非测量所得的胞外物流的计;代谢流分析揭示了代谢流的静态分;代谢流分析是代谢分析的一个重要;赖氨酸产率变化时,其合成途径众;由此，确定G6P节点是挠性的,;结合动力学模型对青霉素的生物合;热力学分析，数学模型等也是代谢;代谢改造在代谢分析确定限制步骤;代谢流量的测定主要方法常规测;常规测定方法发酵液中的各物质成;核磁共振法已经成;蛋白质的质谱研究技术;双向凝胶电泳（2-DE）;图象分析（imageana;质谱技术（MS）;（1）质谱的原理：分子被离子;（3）生物大分子的离子化，对于