基因芯片和RNA-seq联合组织芯片分析CLDN8在乳头状肾细胞癌的表达及意义.pdfVIP

BMEClinMed,May2023,Vol.27,No.3

352生物医学工程与临床2023年5月第27卷第3期

115:08:56

·生物工程·网络出版时间：2023-04-216D0I:10.13339/ki.sglc018

网络出版地址：/kcms/detail/12.1329.R.202M201410036h

tm

基因芯片和RNA-seq联合组织芯片分析CLDN8在

乳头状肾细胞癌的表达及意义

罡2,李生华2h

张观兰,李建棣2a,杨艺洲,许静婕,陈思智1,杨小萱1,陈

为联合基因芯片或RNA测序技术及免疫组织化学染色探究CLDN8在乳头状肾细胞癌（PRCC)中的表达及

摘要：目的

其临床意义。方法通过GeneExpressionOmnibus数据库、SequenceReadArchive数据库、ArrayExpress数据库、癌症基

因组图谱（TCGA）数据库收集PRCC的组织mRNA表达数据集和开展免疫组织化学染色实验检测CLDN8的表达水平，

非配对独立样本检验用于分析在癌组织与非癌组织的表达差异。数据偏倚通过和检验评价。标

tCLDN8DeeksEggers

准化均数差（SMD）、灵敏度、特异度、似然比、汇总受试者工作特性曲线用于评估CLDN8的临床价值。收集TCGA数据库

中PRCC患者的临床病理参数，通过非配对独立样本t检验或方差分析探究CLDN8表达与患者临床病理特征之间的关

系。结果共筛选出7个数据集，包括500例PRCC组织和111例非癌组织，CLDN8在PRCC中显著低表达（SMD=-6.80，

：-8.97~－4.63），在与非癌组织表达差异具有极显著统计学意义（汇总受试者工作特性

95%CIPRCCP0.0001),

曲线下面积趋近于1.00（95%CI:0.99~1.00），灵敏度为0.99（95%CI:0.93~1.00），特异度为0.99（95%CI:0.83~

1.00），阳性、阴性似然比分别为103.39（95%CI:5.16~2069.90）、0.01(95%CI:0.00~0.08）。

表偏倚。CLDN8表达水平与患者性别、年龄、分级分期无明显关联。结论CLDN8表达水平在PRCC中降低，可能与

PRCC的发生、发展相关。

关键词：乳头状肾细胞癌；CLDN8；免疫组织化学染色；基因芯片；RNA测序；预后

中图分类号：R737.11;Q811.4文献标识码：A文章编号：1009-709