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生物化学内容提要、习题与解答

武汉大学生科院张楚富教授等原作!非常感谢!

第二章氨基酸和蛋白质的一级结构

基本内容

蛋白质含有20种标准氨基酸,这些氨基酸在它们的α碳原子上分别含有一个氨基、一个羧基和一个侧链基团

(或称R基团)。除甘氨酸外,所有其它氨基酸的α碳原子都是一个不对称的碳原子,即手性碳原子。蛋白质中的

所有氨基酸都是L-型的。

20种标准氨基酸可以根据它们侧链的结构分为含脂肪烃基的氨基酸、含芳香基的氨基酸、含硫的(或含羟基

的、或含酰胺基的)氨基酸。如果根据它们的侧链极性(或在生理pH下的解离),可分为侧链非极性氨基酸、侧

链不带电荷的极性氨基酸和侧链解离带正电荷或负电荷的氨基酸。氨基酸侧链的性质对于决定蛋白质的性质、结构

和功能来说是很重要的。

氨基酸的α-氨基和α-羧基都是可解离的基团,它们的解离取决于介质的pH。在生理pH下,α-氨基解离带正

电荷(–NH3+),α-羧基解离带负电荷(–COO–);侧链可解离基团的解离取决于它们的pK值和介质的pH。氨

基酸的解离性质是建立分离和分析氨基酸的方法的基础,它们的解离也影响蛋白质的性质、结构和功能。分离分析

氨基酸的主要方法是离子交换法以及电泳法。

蛋白质是由氨基酸借肽键连接而成多聚物。在蛋白质多肽链中,肽键是唯一的共价键,由一个氨基酸的α-羧基

和相邻氨基酸的α-氨基脱水缩合而成。在多肽链中,氨基酸残基的顺序称为蛋白质的一级结构。

蛋白质是生物大分子,虽然它们具有与氨基酸相似的解离性质,但这一性质却比氨基酸复杂。蛋白质的许多重

要的性质,例如,溶解性、极性、带电性质、分子大小以及配体亲和性等,是构成分离分析它们的方法的基础。离

子交换法、凝胶过滤法、亲和层析法、超速离心法以及各种电泳法是常用的方法。

蛋白质一级结构的测定通常采用这样的程序,即纯净样品的末端分析、氨基酸组成分析、专一性酶或化学试剂

进行部分水解、Edman降解法测定肽碎片的氨基酸残基的顺序以及片段重叠。末端分析常有丹磺酰氯法和二硝基

氟苯法;肽链的部分水解一般是有胰蛋白酶法、胰凝乳蛋白酶法以及溴化氰法。

氨基酸顺序的分析能揭示不同来源的蛋白质彼此之间的进化关系,亦为分子病的诊断提供可靠的依据。

第二章氨基酸和蛋白质的一级结构

习题

2–1.图2—1的滴定曲线描述了谷氨酸的电离。请回答下列问题:①指出三个pK’a的位置;②指出Glu-

和Giu=各一半时的pH;③指出谷氨酸总是带净正电荷的pH范围;④指出Glu±和Glu-能作为一种缓冲液的共

轭酸碱对的pH范围.

图2-1谷氨酸的酸-碱滴定曲线

2–2.为什么甘氨酸处在等电点时是以偶极离子的形式存在,而不是以完全不带电荷的形式存在?处在等电点

时,其完全不带电荷的形式是多少?

2–3.甘氨酸是乙酸甲基上的氢被氨基取代生成的,但是,甘氨酸羧基的pK’a值比乙酸羧基pK’a低。为

什么?

2–4.在pH9.0时,计算赖氨酸的两性离子、阳离子以及阴离子所占的比例。已知赖氨酸三个可电离基团α

-COOH,α–NH3+和ε-NH3+的pK’a值分别为2.18、8.95和10.53。

2–5.用强酸型阳离子交换树脂分离下述每对氨基酸,当用pH7.0的缓冲液洗脱时,下述每对中先从柱上洗脱

下来的是哪种氨基酸?

①天冬氨酸和赖氨酸;②精氨酸和甲硫氨酸;⑧谷氨酸和缬氨酸;④甘氨酸和亮氨酸;⑤丝氨酸和丙氨酸。

2–6.计算出由Ala、Gly、His、Lys和Val所构成的可能的五肽数目。

2–7.在大多数氨基酸中,α–COOH的pK’a值都接近2.0,α–NH3+的pK’a值都接近9.0。但是,在肽

中,α–COOH的pK’a值为3.8,而α–NH3+的pK’a比值为7.8。你能解释这种差别吗?

2–8.某蛋白质用凝胶过滤法测定的表观分子量是90D;用SDS测定时,它的表观分子量是60D,

无论2-巯基乙醇是否存在。哪种测定方法更准确?为什么?

2–9.一种分子量为24,000、pI为5.5的酶被一种分子量类似、但pI为7.0的蛋白质和另外一种分子量为

100,000、pI为5.4的蛋白质污染。提

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