酿酒酵母基因表达的网络调控.ppt

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2024-09-28 发布于湖北
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酿酒酵母基因表达的网络调控

TheyeastSaccharomycescerevisiae,

whichatpresentisperhapsthebestcharacterizedmodelorganism.

SpecificityandStabilityinTopologyofProteinNetworks

SergeiMaslov1andKimSneppen2

Theinteractionnetworkusedinthisstudyconsistsof4549physicalinteractionsbetween3278yeastproteinsasmeasuredinthemostcomprehensivetwo-hybridscreenofyeastproteins,whereasthegeneticregulatorynetworkisformedby1289directedpositiveornegativedirecttranscriptionalregulationswithinasetof682proteinsaslistedintheYeastProteinDatabase.

Networkofphysicalinteractionsbetweennuclearproteins.

Inthis“nullmodel”network,allproteinshaveexactlythesameconnectivityasintheoriginalone,whereasthechoiceoftheirinteractionpartnersistotallyrandom.

correlationprofilesofproteininteractionandregulatorynetworksinyeast

correlationsinconnectivitiesofneighbors

Itisfeasiblethatmolecularnetworksinalivingcellhaveorganizedthemselvesinaninteractionpatternthatisbothrobustandspecific.Topologically,thespecificityofdifferentfunctionalmodulescanbeenhancedbylimitinginteractionsbetweenhubsandsuppressingtheaverageconnectivityoftheirneighbors.

IntegratedGenomicandProteomicAnalysesofaSystematicallyPerturbedMetabolicNetworkSCIENCEVOL2924MAY2023

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