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第三章

RNA生物合成;RNA组成及结构

RNA聚合酶

开启子结构

RNA合成过程

RNA前体加工;1引言

转录(transcription):以DNA单链为模板,按照碱基配对规则,酶(DdRp)促合成互补于模板DNA单链片段RNA过程。是基因表示关键步骤。;关于基因有义链和编码链等概念

基因DNA(+)链——有义链——编码链

基因DNA(-)链——反义链——模板链

与mRNA序列相同那条DNA链称为编码链;将另一条依据碱基互补标准指导mRNA合成DNA单链称为模板链。

这种新定义主要是基于以下考虑:

非模板链碱基次序与以模板链为模板转录出来RNA碱基次序一致(只是T与U有别)。

(2)便于将有义链(即编码链)DNA序列直接与氨基酸密码子相对应起来。;;例题:试判断以下题目中哪条链为基因有义链(编码链)?

a.5'—ATGAAATTTCCCGGGGTA—3’

b.3'—TACTTTAAAGGGCCCCAT—5'

c.5'—AUGAAAUUUCCCGGGGUA—3'

d.—MetLysPheProGlyVal—;2RNA结构及种类

2.1组成与结构

(1)RNA是多核糖核苷酸链,含有AMP、CMP、GMP和UMP等残基。主链由相间排列磷酸和核糖所组成。侧链碱基为A、G、C和U等。;;;;与mRNA相关几个概念:

基因:编码一条多肽链或功效RNA所必需全部核苷酸序列。

基因种类:(1)结构基因(structuralgenes)与调整基因(regulatorygenes);(2)功效RNA基因,如,rRNA基因和tRNA基因等。

转录单元(transcriptionunit):一段从开启子开始至转录终止子结束DNA序列。代表一个基因或操纵子。

严格地说,不能将开启子(promoter)和操纵基因称之为基因。;读码框(openreadingframe,ORF):mRNA分子上自起始密码子至终止密码子之间三个一组碱基序列。

单顺反子mRNA:只编码一条多肽链mRNA。

多顺反子mRNA:编码几条不一样多肽链mRNA。

隔离序列:多顺反子mRNA中顺反子之间间隔序列。

SD序列:mRNA中用于结合原核生物核糖体序列。;前导序列:mRNA中5′端和肽链合成起始点所对应碱基之间序列。;2.3RNA酶促合成特点

(1)以一条DNA链为模板。试验证据:新合成RNA只能与一条DNA链杂交。

(2)RNA合成反应不需要引物,RNA聚合酶无校正功效。

(3)新链延伸方向:5′→3′。试验证据:新加入核苷酸均出现于3′端。

(4)合成用底物为NTP(N:A、G、U、C),模板DNA链与新合成RNA之间碱基配对规律为dT-A、dA-U、dG-C、dC-G。;2.4转录与复制异同

相同点:都需要依赖DNA聚合酶;都以DNA为模板;聚合酶沿模板链移动方向均为3′→5′;新链延伸方向均为5′→3′;恪守碱基互补配对规律;产物为多聚核苷酸链。

不一样点复制转录

特征半保留复制不对称转录

模板用量两股链均作为模板模板链作为模板

原料dNTP(N:A,T,G,C)NTP(N:A,U,G,C)

聚合酶DNA聚合酶RNA聚合酶

校对机制有无

引物需RNA引物不需引物

碱基配对A-T,G-CdA-U,dT-A,dG-C,dC-G

产物子代DNA双链mRNA,tRNA,rRNA;3RNA聚合酶与开启子

3.1原核生物RNA聚合酶;全酶:α2ββ′ωσ负责开启子选择和转录起始

关键酶:α2ββ′ω负责新生RNA链延伸

σ因子:有各种σ因子,用于识别不一样开启子;;DN

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