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ctDNA检测

MajorCancerPanel(艾美诺)是以癌症患者外周血中的循环肿

瘤DNA(ctDNA)和/或肿瘤病灶组织为样本,基于探针捕获技术原理,

针对靶向用药基因、耐药基因,化疗用药基因,肿瘤关键驱动基因,

复发监控基因,涵盖CFDA、FDA、NCCN指南推荐及临床研究阶段

等的119个癌症相关基因设计的panel,可检测与癌症(肺癌、乳腺

癌、结直肠癌、胃肠道间质瘤、黑色素瘤等二十几种肿瘤)的相关

基因,一次性检测SNV、indel、fusion、CNV多种基因变异类型,

突变检出率精准至0.1%。为科研工作者在肿瘤进化、肿瘤基因分型、

实时监控、预后反应等等方面提供技术助

力。MajorCancerPanel的设计参考CAPP-Seq方法原理。

MajorCancerPanel基因列表

融合基因检测(ALK、ROS1、RET)

癌种及人群检出率(PatientCoverage)

通过对每一种癌症的近万名患者的测序结果进行统计,

MajorCancerPanel能够检测到携带肿瘤特异性突变的患者的概率。

技术优势:

1.精准:美吉拥有基因组污染识别专利及自主研发的单分子标记

技术,提高检测灵敏性和特异性,对目标区域的覆盖率超过99%;

2.可靠:对肿瘤组织和血液ctDNA均进行检测,双重验证,获得

更可靠的检测结果;

3.安全:对于不愿意取组织或需要持续监控疾病进展的患者,仅

需15ml外周血即可进行检测;

4、快速:基于NextSeqCN500基因测序仪,建库完成后1天即

可完成测序。

服务流程

应用方向

技术参数

结果展示

1.组织活检与无创活检(ctDNA)突变频率一致性比较

2.基因型检测结果

在来自于41位肺癌患者的103个血液样本中提取cfDNA,并利

用癌症Panel对基因EGFR进行捕获,得到不同的突变类型(左图),随

后Sanger测序验证突变位点,例如EGFRexon19L747_A750del突

变(右图)

3.融合基因检测结果

在来自于19位非小细胞肺癌患者的的19个血液样本中检测

EML4-ALK融合基因,结果如图A所示。发生融合的位点有18个都集

中在ALK的20号外显子上,只有一个患者是在ALK的21号外显子区

域。而发生在EML4上的融合突变位点则是多元化的,2号、6号、18

号、13号和20号外显子区域都有分布。

在来自于同一个非小细胞肺癌患者的不同时间点的4个血液样本

中检测ALK基因上的融合位点,IGV绘图结果图B所示。

4.CNV检测结果(N1至N10是十位正常人的血浆样本,其余为

癌症患者的血浆样本)

5.肿瘤实时监控

通过CT影像学检测报告的肿瘤大小与ctDNA的检测含量比较,

发现两者变化趋势一致。

6.肿瘤异质性

对CO43患者在治疗前和治疗后分别取血样,测序后发现治疗后

的样本存在新的突变C797S,并且C797S的突变比例与原有突变

T790M一致,说明C797S很可能是肿瘤由于治疗敏感性生成了新的

驱动突变。每50天一次,为期330天的跟踪采样结果显示,C797S

突变的发生及发展趋势与原有突变T790M高度一致,也说明了肿瘤异

质性的产生。

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