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ctDNA检测
MajorCancerPanel(艾美诺)是以癌症患者外周血中的循环肿
瘤DNA(ctDNA)和/或肿瘤病灶组织为样本,基于探针捕获技术原理,
针对靶向用药基因、耐药基因,化疗用药基因,肿瘤关键驱动基因,
复发监控基因,涵盖CFDA、FDA、NCCN指南推荐及临床研究阶段
等的119个癌症相关基因设计的panel,可检测与癌症(肺癌、乳腺
癌、结直肠癌、胃肠道间质瘤、黑色素瘤等二十几种肿瘤)的相关
基因,一次性检测SNV、indel、fusion、CNV多种基因变异类型,
突变检出率精准至0.1%。为科研工作者在肿瘤进化、肿瘤基因分型、
实时监控、预后反应等等方面提供技术助
力。MajorCancerPanel的设计参考CAPP-Seq方法原理。
MajorCancerPanel基因列表
融合基因检测(ALK、ROS1、RET)
癌种及人群检出率(PatientCoverage)
通过对每一种癌症的近万名患者的测序结果进行统计,
MajorCancerPanel能够检测到携带肿瘤特异性突变的患者的概率。
技术优势:
1.精准:美吉拥有基因组污染识别专利及自主研发的单分子标记
技术,提高检测灵敏性和特异性,对目标区域的覆盖率超过99%;
2.可靠:对肿瘤组织和血液ctDNA均进行检测,双重验证,获得
更可靠的检测结果;
3.安全:对于不愿意取组织或需要持续监控疾病进展的患者,仅
需15ml外周血即可进行检测;
4、快速:基于NextSeqCN500基因测序仪,建库完成后1天即
可完成测序。
服务流程
应用方向
技术参数
结果展示
1.组织活检与无创活检(ctDNA)突变频率一致性比较
2.基因型检测结果
在来自于41位肺癌患者的103个血液样本中提取cfDNA,并利
用癌症Panel对基因EGFR进行捕获,得到不同的突变类型(左图),随
后Sanger测序验证突变位点,例如EGFRexon19L747_A750del突
变(右图)
3.融合基因检测结果
在来自于19位非小细胞肺癌患者的的19个血液样本中检测
EML4-ALK融合基因,结果如图A所示。发生融合的位点有18个都集
中在ALK的20号外显子上,只有一个患者是在ALK的21号外显子区
域。而发生在EML4上的融合突变位点则是多元化的,2号、6号、18
号、13号和20号外显子区域都有分布。
在来自于同一个非小细胞肺癌患者的不同时间点的4个血液样本
中检测ALK基因上的融合位点,IGV绘图结果图B所示。
4.CNV检测结果(N1至N10是十位正常人的血浆样本,其余为
癌症患者的血浆样本)
5.肿瘤实时监控
通过CT影像学检测报告的肿瘤大小与ctDNA的检测含量比较,
发现两者变化趋势一致。
6.肿瘤异质性
对CO43患者在治疗前和治疗后分别取血样,测序后发现治疗后
的样本存在新的突变C797S,并且C797S的突变比例与原有突变
T790M一致,说明C797S很可能是肿瘤由于治疗敏感性生成了新的
驱动突变。每50天一次,为期330天的跟踪采样结果显示,C797S
突变的发生及发展趋势与原有突变T790M高度一致,也说明了肿瘤异
质性的产生。
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