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宏基因组分析和诊断技术在急危重症感染应用的专家共识--第1页
宏基因组分析和诊断技术在急危重症感染应用的专家共识
感染是急危重症患者死亡的主要原因之一。近年来，随着新发病原微生物的出现、耐
药病原微生物的增多以及免疫抑制宿主的增加，感染的发病率和死亡率仍居高不下，脓毒症
(严重感染)患者病死率高达50%[1-3]。必威体育精装版调查研究发现，中国脓毒症相关性标化死亡率为
66.7例/10万人口，全国每年共有脓毒症相关性死亡病例近103万例。重症感染起病急、
[3]
进展快、病原体复杂，短时间内能否明确致病病原微生物至关重要。
传统的病原微生物检测方法主要包括形态学检测、培养分离、生化检测、免疫学和核
酸检测。因操作简单、快速、技术要求不高，同时具有一定的诊断敏感性和特异性，目前仍
在临床上广泛使用。但传统的检测方法在敏感性、特异性、时效性、信息量等方面存在局限，
而且对于未知或者罕见的病原微生物，无法快速识别。
基于宏基因组新一代测序技术(metagenomicsnext-generationsequencing，
mNGS)不依赖于传统的微生物培养，直接对临床样本中的核酸进行高通量测序，然后与数
据库进行比对分析，根据比对到的序列信息来判断样本包含的病原微生物种类，能够快速、
客观地检测临床样本中的较多病原微生物(包括病毒、细菌、真菌、寄生虫)，且无需特异性
扩增[4-8]，尤其适用于急危重症和疑难感染的诊断。
为了规范运用mNGS进行病原微生物的诊断、正确解读检测结果和指导治疗，我们组
织了急危重病、感染病学和病原微生物学相关领域的专家，制定了本共识。
1mNGS分析和诊断技术是急危重症感染快速、精准诊疗的发展方向
新一代测序技术是一个开放的分析和诊断系统，目前已经纳入的病原体有8000多种，
其中包括3000余种细菌、4000余种病毒、200余种真菌和140种寄生虫，为疑难危重症
及罕见病原微生物感染的诊断提供了有效的技术手段。
自2008年成功应用于临床诊断新发病原体感染以来[9-10]，目前mNGS技术已经逐步
用于临床疑难感染诊断，如华山医院张文宏团队用mNGS协助确诊猪疱疹病毒的跨物种
[11]
传播，并给予针对性治疗使患者痊愈，深圳市第三人民医院用mNGS确诊了一例罕见阿米
巴脑炎[11-12]。
mNGS对脓毒症、免疫抑制宿主并发严重感染、重症肺部感染等疾病具有较高的临床
应用价值，能够快速、精准地找到病原体；另外对于抗菌药物治疗方案的制定和治疗效果的
评估具有一定的指导作用。Long等研究发现血培养联合mNGS诊断细菌或真菌感
[9-16][17]
染，阳性率较单用血培养显著升高。以健康人群为基线，建立每种微生物在正常人群中的分
布情况模型，进而计算脓毒症指数来评估检出微生物的核酸数量，Crumaz等[18]发现在脓
毒症患者血液标本中病原菌的脓毒症指数绝对值、丰度显著升高，而且其变化与临床治疗效
宏基因组分析和诊断技术在急危重症感染应用的专家共识--第1页
宏基因组分析和诊断技术在急危重症感染应用的专家共识--第2页
果密切相关。通过对比健康志愿者与脓毒症患者的测序结果，Gosiewski等[18]发现健康人
群中主要以厌氧菌、双歧杆菌等非致病菌为主，而脓症患者以需氧菌或
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