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从0开始搭建R语言数据分析平台

本文从实用的角度，一步步搭建一个基于R语言的数据分析和可视化（作图）平台，完成相关的系统配置和软件设置，达到“拿来即用”的目的。本文是“R语言基础系列”的第一篇,该系列共分3篇,第二篇讲R语言的基本操作，第三篇讲R语言的基本图形。这一系列的介绍完成之后，读者已经可以利于R语言进行基本的数据管理、分析和可视化工作.

本文包括3个部分：1、下载和安装R、RStudio；2、相关配置和设置；3、一些常见问题。

完成后的样子如下图所示：

1、下载和安装R、RStudio

这两个软件都是开源软件,均可在网上自由下载，不需要付费注册.R支持win7以后的系统，winXP已经不再支持。下载R的时候要选择国内的镜像站点，这样速度更快。第一次安装选择“base选项。进入下载页面，选择必威体育精装版版本（当前为4。02)：DownloadR4.0。2forWindows。这个文件包含32bit和64bit两个版本的组件,所以不管系统是32bit还是64bit都只下载这一个文件。等待文件R4.02下载完成。该文件是一个可执行文件(。exe），在windows系统中双击即可运行。

下载RStudio时，选择RStudioDesktopFree(桌面版免费版)。若是64位系统,则直接下载必威体育精装版版本，当前版本是1。3。1073。若是32位系统则点击页面下方的链接，下载老版本,版本号为1。2.5042。

下载完成后得到两个可执行文件：

安装R和RStudio：

首先，运行R—4.0。2—win.exe。选择安装语言，下一步,设置安装目录，选择安装组件。

在“选择组件”这一步要注意区分32—位和64—位windows系统.若是64—位系统则全选，若是32-位系统则取消64-bitFiles。

下一步，接受默认设置即可。

下一步,不要关联.Rdata文件，稍后用RStudio关联。

等待安装完成.

接下来安装RStudio：

双击运行安装程序，下一步选择安装目录，下一步安装，等待安装完成即可.

2、相关配置和设置

(1）设置环境变量：涉及系统对R的调用。

右击计算机-属性-高级系统设置：

再点击右下角的“环境变量”:

然后编辑系统变量PATH的值，在原有值后面添加R启动文件的位置,与原有值之间用英文分号“；”隔开，如：“；D：\ProgramFiles\R\R-4.0。2\bin\x64”.

（2）RStudio界面的设置：Tools–GlobalOptions–Appearance中设置编辑器主题（Editortheme）,找一个黑色背景，这样在长时间编写、阅读代码时眼睛受光线刺激较小。

（3）R软件库的设置：Tools–GlobalOptions–Packages中设置一个中国的镜像，这样安装软件时速度较快。

（4）设置面板：在RStudio工具栏中有一个田字格状的按钮,可以设置面板的样式，将R控制台放在右侧（ConsoleonRight），这样可以并排查看脚本编辑器代码和已运行的R控制台代码。

（5）安装R中常用的包：agricolae（农业田间试验)、nlme（非线性混合模型）、xlsx(excel文件读写）、reshape2（数据转换）、ggplot2(高级作图)、gplots(热图作图)、lme4（线性混合模型）、emmeans（边际效应）、psych（相关分析）、multcompView（多重比较）。

图形化操作：在右下角的面板中,点击Packages—Install,打开软件包安装管理器:

输入软件包的名称,点击安装（Install)即可自动安装软件包,并自动安装相关的依赖程序包。

命令行模式:运行下面一段命令,一次性完成全部所需软件包的安装.

update.packages()＃安装之前先升级原有的包,防止出现依赖问题

install。packages（c（“agricolae，“nlme,“xlsx”,“reshape2”，“ggplot2”，“gplots”，“lme4”，“emmeans”，“psych”,“multcompView”))

。libPaths（)＃查看安装位置

（6）安装并配置JAVA:某些软件包使用JAVA，所以必须安装JDK.在网上下载必威体育精装版的JDK,安装后要设置环境变量，象上述R环境变量设置过程一样，在系统变量中PATH变量值增加Java相关启动程序的位置。如下图所示：

3、一些常见问题

Rstudio与ATI显卡有冲突。在双显卡的电脑中,若独立显卡是ATI的,为Rstudio配置成独立显卡则会出错，提示加载库异常，无法打开。为其配置为核心显卡模式则没有异常。

R语言的升级比较复杂。一般地，要先卸载老版本R,卸载完成后