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蛋白同源建模及分子对接;;QMEAN(QualitativeModelEnergyAnalysis);蛋白模型局部(每个氨基酸)Z-score;Z-score在pdb数据库中所有蛋白中的分布;Modeller软件;Easymodeller建模——确定模板;Easymodeller界面;以4e9q.A为模板,建立了CueO的蛋白模型,左图为不含有铜辅基的模型,右图为含有4个铜辅基的模型。;蛋白模型的检测与评价
——以Swiss-model构建的CueO模型为例;SAVE网站评估蛋白模型;Procheck;ERRAT;verify3d;Prove;结果总结;蛋白模型的优化;Chiron优化前后分子能量对比
;Save检测优化后的模型;Autodock4.0分子对接;准备受体和配体;Gridbox参数设置;分子对接结果展示;待解决的问题;此课件下载可自行编辑修改,仅供参考!
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