群体有效含量的计算.ppt

关于群体有效含量的计算关于保种保种保存一个群体的种质资源(遗传资源)保种特点：小群体活体保种为主不进行选择、迁移，防止突变产生随机遗传漂变是影响保种效果的主要因素遗传漂变的效应导致群体内纯合子增加导致群体内杂合子频率降低导致群体内基因频率的方差降低第2页,共11页，星期六，2024年，5月群体有效含量：与实际群体有相同基因频率方差或相同的杂合度衰减率的理想群体含量Ne理想群体：群体含量在世代间保持恒定、群体内随机交配、无世代重叠、无其它遗传效应影响确定群体有效含量有两种方式：以等基因频率方差得到(称方差有效含量)以等杂合度衰减率得到(称近交有效含量)群体有效含量第3页,共11页，星期六，2024年，5月理想群体的基因频率方差指群体中亲子代间基因频率抽样方差，即基因频率变动方差，用表示。理想群体的杂合度衰减率即近交系数增量：反映群体遗传结构中基因的平均纯合速度,用?F表示。第4页,共11页，星期六，2024年，5月完全随机交配(随机留种)公母畜数目不相等的情况公畜数量为Ns，母畜数量为NdN=Ns+Nd下一代基因频率为雌雄个体中基因频率的平均值p=1/2(ps+pd)可推导出：又：，根据方差相等，可得：不同情况下群体有效含量的计算第5页,共11页，星期六，2024年，5月所以，在完全随机留种情况下：第6页,共11页，星期六，2024年，5月完全随机交配(随机留种)公母畜数目相等的情况Ns＝Nd＝N/2（N为群体实际含量）根据：可以得到：Ne＝N即：随机留种且公母畜数目相等时，群体有效含量与群体实际含量相等。不同情况下群体有效含量的计算第7页,共11页，星期六，2024年，5月各家系等数留种各家系公母畜数目不相等的情况各家系留种相同数目公畜和相同数目的母畜此时，群体有效含量的计算为：不同情况下群体有效含量的计算第8页,共11页，星期六，2024年，5月各家系等数留种各家系公畜数目与母畜数目相等的情况Ns＝Nd＝N/2（N为群体实际含量）根据：可得：Ne＝2N即：各家系等数留种且公母畜数目相等的情况下，群体有效含量是群体实际含量的两倍。不同情况下群体有效含量的计算第9页,共11页，星期六，2024年，5月作业：实习十二（一）今有一个由2000头母牛和20头公牛组成的封闭牛群，试计算：（1）当20头公牛都用于本交时的牛群有效含量；（2）采用人工授精后配种公牛减至5头时的牛群有效含量；（3）采用和不采用人工授精时的近交速率。（二）今有两个由100只母鸡和10只公鸡组成的鸡群，分别采用随机留种法和各家系等数留种法，要求计算出各自的群体有效含量和近交速率，然后加以比较和文字说明。（三）今有一保种核心群，拟选集100只优秀母羊，试问（1）各家系等数留种情况下，需要多少只公羊，才能使群体有效含量保持为100头？（2）如采用随机留种法，公羊需增加到多少只？（四）有A、B、C三个群体，总头数都是100头，计算它们的群体有效含量和近交速率各是多少？(分随机留种和各家系等数留种计算)A群：♂50♀50B群：♂20♀80C群：♂5♀95均为随机交配第10页,共11页，星期六，2024年，5月感谢大家观看第11页,共11页，星期六，2024年，5月