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QPCR题库.--第1页

QPCR题库.

1.简述QPCR的原理,并写出其数学公式(不用写推导过程)。

任一样本q目的基因x达到阈值时分子数

Xqx=X0×(1+EX)ctx

任一样本q目的内标基因r达到阈值时分子数

Xqr=R0×(1+ER)ctr

Xqx=Xqr

X0×(1+EX)ctx=R0×(1+ER)ctr

X0/R0=(1+ER)ctr/(1+EX)ctx

对于一个小于150bp的扩增片断而言,如果Mg2+浓度、引物都

进行了适当的优化,扩增效率接近于1。

2.QPCR染料法与探针法的异同?

探针类是利用与靶序列特异杂交的探针来指示扩增产物的增加,

特异性高

染料类则是利用荧光染料或者特殊设计的引物来指示扩增的增加,

简便易行。

SYBRGreenI是一种与双链DNA结合发光的荧光染料。所以可

以根据SYBRGreenI的荧光信号强度检测出PCR体系存在的双链

DNA数量SYBRGreenI的最大吸收波长约为497NM,发射波长最大

约为520NM

优点:通用性较好,价格相对低廉,国内外科研中使用比较普遍。

缺点:由于SYBRGreenI不能识别特异的双链,对PCR反应中

的非特异性扩增及引物二聚体也会产生荧光,本底较高,临床应用时

会有假阳性出现

TaqMan探针是一种寡核苷酸探针,它设计与目标序列上游引物

和下游引物之间的序列配对。

常用的荧光由FAM,TET,VIC,HET,荧光淬灭基团如TAMRA

荧光基团连接在探针的5’末端,而淬灭剂则在3’末端。当完整

的探针与目标序列配对时,荧光基团发射的荧光因与3’端的淬灭剂接

QPCR题库.--第1页

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近而被淬灭。但在进行延伸反应时,聚合酶的5’外切酶活性将探针进

行酶切,使

得荧光基团与淬灭剂分离。随着扩增循环数的增加,释放出来的

荧光基团不断积累。因此荧光强度与扩增产物的数量呈正比关系。

Taqman探针检测的是积累荧光。当探针完整的时候,由于3?端

的荧光淬灭基团在吸收5?端报告基团所发射的荧光能量,本身会发射

波长不同的荧光而导致本底高,因此TaqMan探针近来又有新的发展

——TaqManMGB探针。

MGB探针的淬灭基团采用非荧光淬灭基团(Non-Fluorescent

Quencher),本身不产生荧光,可以大大降低本底信号的强度。同时

探针上还连接有MGB(MinorGrooveBinder)修饰基团,可以将探针

的Tm值提高10°C左右。因此为了获得同样的Tm值,MGB探针可

以比普通TaqMan探针设计得更短,既降低了合成成本,也使得探针

设计的成功率大为提高——因为在模板的DNA碱基组成不理想的情况

下,短的探针比长的更容易设计。实验证明,TaqManMGB探针对于

富含A/T的模板可以区分得更为理想。

3.理论上来说,标准曲线的第一梯度和第二梯度的CT值,相差多

少?为什么。

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