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从一篇预测模型文章学习nomogram列线图

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文章题目是:使用Nomograms预测接受联合细胞毒性化疗作为

一线治疗的不可切除或转移性胃癌患者的生存率。研究的对象是949

例化疗的胃癌患者,观察终点是1年后患者的生存情况。使用的方法

是Cox生存分析,预测模型的展示方法是nomogram列线图。

图一:Flowchart流程图

我们还是从图表的角度剖析这篇文章。第一个图是大家最熟悉的

流程图,流程图的重要性就不在强调了,几乎每篇文章必备。文章收

集了2001年到2006年共计1327例接受化疗的胃癌患者。排除328

人,剩余949人进入Cox模型。

表一:研究人群描述

如果说图一看不出什么端倪,那么从表一开始,这篇文章的独特

之处就可以显现出来了:作者把人群分成了2组,一组是基线列线图

人群,一组是基于化疗反应列线图人群。

这是什么意思呢?作者整篇文章共做了2个预测模型,一个是基

于患者化疗之前的危险因素进行预测,另一个则是化疗开始后9周观

察到患者对化疗初期反应之后的因素进行预测。

换句话说,当一个胃癌患者来了之后,首先可以通过基线数据进

行风险评估预测,决定是否进行接受联合细胞毒性化疗。患者化疗之

后,可以通过初期化疗反应再次进行评估,决定是否继续化疗。两个

模型结合为医生提供化疗决策的帮助。

其实这个时候作者的思路就已经显现出来了,这也是文章的核心

亮点,可以猜想,作者下面的内容则是围绕2个模型进行书写,我们

继续往下看。

表二:预测因子筛选

表二是文章的重要内容:纳入列线图的危险因素,这里展示了预

测模型用到的变量,同时展示了每个危险因素的HR风险比。

预测模型的难点在于预测因子的筛选,很多同学都在苦恼用什么

原则选择,这篇文章则描述的非常清楚,大家可以学习。简单概述一

下:文章首先使用基础模型和年龄调整模型进行单因素分析,定义出

来潜在的危险因素,然后使用前进、后退、逐步分析方法在多因素模

型中筛选出了最佳模型。在使用这些方法的时候,一类错误α的取值

为0.20,也就是p

同时,在这个表中最下面一列,展示出来2个模型的最大差异之

处:化疗后9周之内的反应。基线nomogram中没有这个变量,基于

化疗反应的nomogram则使用了这个变量。

图二:nomogram列线图

最后一步就是展示列线图了,有了前面表二的铺垫,图二分别展

示了2个模型的nomogram,1个基于基线资料预测,1个基于化疗

后初期反应预测,一切水到渠成。文章没有再放ROC曲线,直接列出

了2个模型的C-index分别是0.656(95CI%,0.628-0.673)和

0.718(95CI%,0.694-0.741)

图四、表三:校准曲线和风险分层

最后的图和表作为文章的辅助材料,我一并放出来。一个是列线

图的校准曲线,校准曲线是实际风险和预测风险的对比,曲线约接近

对角线,说明预测效果越好。

第二个图则是按照风险大小进行分层,分别展示了每组的人数和

中为生存时间,从侧面说明了不同风险值患者的实际生存情况,让大

家对生存时间有更直接的认识。

以上就是这篇文章的全部内容啦,我们简单整理一下思路:作者

通过对医院现有化疗患者数据进行挖掘,建立了2个模型:一个是在

化疗开始前进行预后评估,另一个是在化疗初期,通过化疗反应进行

预后评估。2个模型是文章的最大亮点,nomogram作为载体展示了

预测模型的结果,较为新颖。

科室特色疾病数据的挖掘是一种非常常见的思路来源,也是大家

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