NCBI分子数据库介绍.pdfVIP

  1. 1、本文档共4页,可阅读全部内容。
  2. 2、有哪些信誉好的足球投注网站(book118)网站文档一经付费(服务费),不意味着购买了该文档的版权,仅供个人/单位学习、研究之用,不得用于商业用途,未经授权,严禁复制、发行、汇编、翻译或者网络传播等,侵权必究。
  3. 3、本站所有内容均由合作方或网友上传,本站不对文档的完整性、权威性及其观点立场正确性做任何保证或承诺!文档内容仅供研究参考,付费前请自行鉴别。如您付费,意味着您自己接受本站规则且自行承担风险,本站不退款、不进行额外附加服务;查看《如何避免下载的几个坑》。如果您已付费下载过本站文档,您可以点击 这里二次下载
  4. 4、如文档侵犯商业秘密、侵犯著作权、侵犯人身权等,请点击“版权申诉”(推荐),也可以打举报电话:400-050-0827(电话支持时间:9:00-18:30)。
  5. 5、该文档为VIP文档,如果想要下载,成为VIP会员后,下载免费。
  6. 6、成为VIP后,下载本文档将扣除1次下载权益。下载后,不支持退款、换文档。如有疑问请联系我们
  7. 7、成为VIP后,您将拥有八大权益,权益包括:VIP文档下载权益、阅读免打扰、文档格式转换、高级专利检索、专属身份标志、高级客服、多端互通、版权登记。
  8. 8、VIP文档为合作方或网友上传,每下载1次, 网站将根据用户上传文档的质量评分、类型等,对文档贡献者给予高额补贴、流量扶持。如果你也想贡献VIP文档。上传文档
查看更多

精品

NCBI分子数据库介绍

信息来源:中国生命科学论坛更新时间:2003-10-122:33:00

核酸序列(nucleotides)

Entrez·核酸-用accessionnumber,作者姓名,物种,基因/蛋白名字,以及很多其它的文本术语来有哪些信誉好的足球投注网站核酸

序列记录(在GenBank+PDB中)。更多的关于Entrez的信息见下。如果要检索大量数据,也可使用BatchEntrez

(批量Entrez)。

RefSeq-NCBI·数据库的参考序列。校正的,非冗余集合,包括基因组DNAcontigs,已知基因的mRNAs和

蛋白,在将来,整个的染色体。Accessionnumbers用NT_xxxxxx,NM_xxxxxx,NP_xxxxxx,和NC_xxxxxx的

形式来表示。

dbEST-·表达序列标签数据库,短的、单次(测序)阅读的cDNA序列。也包括来自于差异显示和RACE实验

的cDNA序列。

dbGSS-·基因组调查序列的数据库,短的、单次(测序)阅读的cDNA序列,exontrap获得的序列,

cosmid/BAC/YAC末端,及其他。

dbSTS-·序列标签位点的数据库,短的在基因组上可以被唯一操作的序列,用于产生作图位点。

dbSNP-·单核苷酸多态性数据库,包括SNPs,小范围的插入/缺失,多态重复单元,和微卫星变异。

完整的基因组

·参见Genome和Maps部分,包括各种物种资源,人,小鼠,大鼠,酵母,线虫,疟原虫,细菌,病毒,

viroids,质粒。

UniGene-·被整理成簇的EST和全长mRNA序列,每一个代表一种特定已知的或假设的人类基因,有定位图

和表达信息以及同其它资源的交叉参考。序列数据可以以cluster形式在Unigene网页下载,完整的数据可以

从FTP站点repository/UniGene目录下下载。

1.奶牛UniGene

2.人类UniGene

3.小鼠UniGene

4.大鼠UniGene

5.斑马鱼UniGene

BLAST-·将你的序列同核酸库中的的序列比较,检索相似的序列。(更详细的信息见下面Tools/Sequence相

似有哪些信誉好的足球投注网站部分)

蛋白序列(proteins)

感谢下载载

精品

Entrez·蛋白-用accessionnumber,作者姓名,物种,基因/蛋白名字,以及很多其它的文本术语来有哪些信誉好的足球投注网站蛋白序

列记录(在GenPept+Swiss-Prot+PIR+RPF+PDB中)。更多的关于Entrez的信息见下。如果要检索大

量数据,也可使用BatchEntrez(批量Entrez)。

RefSeq-NCBI·数据库的参考序列。Curated,非冗余集合包括基因组DNAcontigs,已知基因的mRNAs和蛋

白,在将来,整个的染色体。Accessionnumbers用NT_xxxxxx,NM_xxxxxx,NP_xxxxxx,和NC_xxxxxx的形

式来表示。

FTPGenPept-·下载下载文件,这个文件包含了从GenBank/EMBL/DDBJ记录中翻译过来的

FASTA格式的氨基酸序列,这些记录都有一到两个CDS特性的描述。

ConservedDomainDatabase(CDD)-·蛋白质经常包含若干模块或域,每个有不同的进化源及功能。

CD-Search服务可用来标记保存域中的蛋白质序列。

文档评论(0)

181****5707 + 关注
实名认证
文档贡献者

该用户很懒,什么也没介绍

1亿VIP精品文档

相关文档