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精品
NCBI分子数据库介绍
信息来源:中国生命科学论坛更新时间:2003-10-122:33:00
核酸序列(nucleotides)
Entrez·核酸-用accessionnumber,作者姓名,物种,基因/蛋白名字,以及很多其它的文本术语来有哪些信誉好的足球投注网站核酸
序列记录(在GenBank+PDB中)。更多的关于Entrez的信息见下。如果要检索大量数据,也可使用BatchEntrez
(批量Entrez)。
RefSeq-NCBI·数据库的参考序列。校正的,非冗余集合,包括基因组DNAcontigs,已知基因的mRNAs和
蛋白,在将来,整个的染色体。Accessionnumbers用NT_xxxxxx,NM_xxxxxx,NP_xxxxxx,和NC_xxxxxx的
形式来表示。
dbEST-·表达序列标签数据库,短的、单次(测序)阅读的cDNA序列。也包括来自于差异显示和RACE实验
的cDNA序列。
dbGSS-·基因组调查序列的数据库,短的、单次(测序)阅读的cDNA序列,exontrap获得的序列,
cosmid/BAC/YAC末端,及其他。
dbSTS-·序列标签位点的数据库,短的在基因组上可以被唯一操作的序列,用于产生作图位点。
dbSNP-·单核苷酸多态性数据库,包括SNPs,小范围的插入/缺失,多态重复单元,和微卫星变异。
完整的基因组
·参见Genome和Maps部分,包括各种物种资源,人,小鼠,大鼠,酵母,线虫,疟原虫,细菌,病毒,
viroids,质粒。
UniGene-·被整理成簇的EST和全长mRNA序列,每一个代表一种特定已知的或假设的人类基因,有定位图
和表达信息以及同其它资源的交叉参考。序列数据可以以cluster形式在Unigene网页下载,完整的数据可以
从FTP站点repository/UniGene目录下下载。
1.奶牛UniGene
2.人类UniGene
3.小鼠UniGene
4.大鼠UniGene
5.斑马鱼UniGene
BLAST-·将你的序列同核酸库中的的序列比较,检索相似的序列。(更详细的信息见下面Tools/Sequence相
似有哪些信誉好的足球投注网站部分)
蛋白序列(proteins)
感谢下载载
精品
Entrez·蛋白-用accessionnumber,作者姓名,物种,基因/蛋白名字,以及很多其它的文本术语来有哪些信誉好的足球投注网站蛋白序
列记录(在GenPept+Swiss-Prot+PIR+RPF+PDB中)。更多的关于Entrez的信息见下。如果要检索大
量数据,也可使用BatchEntrez(批量Entrez)。
RefSeq-NCBI·数据库的参考序列。Curated,非冗余集合包括基因组DNAcontigs,已知基因的mRNAs和蛋
白,在将来,整个的染色体。Accessionnumbers用NT_xxxxxx,NM_xxxxxx,NP_xxxxxx,和NC_xxxxxx的形
式来表示。
FTPGenPept-·下载下载文件,这个文件包含了从GenBank/EMBL/DDBJ记录中翻译过来的
FASTA格式的氨基酸序列,这些记录都有一到两个CDS特性的描述。
ConservedDomainDatabase(CDD)-·蛋白质经常包含若干模块或域,每个有不同的进化源及功能。
CD-Search服务可用来标记保存域中的蛋白质序列。
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