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微生物学读书笔记
微生物学读书笔记
【篇一:微生物学文献读书笔记】
微生物学文献读后感
一、文章题目
anovelapproachforassessingthesusceptibilityof
escherichiacolitoantibiotics(评估大肠杆菌对抗生素易感性的
一种新方法)
二、文章概要
escherichiacolicvcc249在不同抗生素浓度下的动态增长过程的
分析结果表明,不能获得理想的最终结果的原因是用ast法不能完
全确定药物浓度和细菌数量之比以及药物浓度和作用时间的综合效应。
基于一系列浓度梯度的庆大霉素处理一定时间细菌的增长过程的分析,
以及根据向前差分法,一种ast新方法被提了出来。
三、研究背景
1、ast(药敏试验)是临床微生物学实验室最重要的任务之一,
它
通常定性在mic(最低抑制浓度)和mbc(最低杀菌浓度),这
是
由不同的杀菌方法和纸片扩散确定的。从ast获得的参数通常用来
表明抗性反应或细菌对抗生素的敏感性,利用这些结果提供合理用药
指导。
2、然而,由于ast的结果容易受到许多不确定因素的影响,使得
耐
药性和敏感性之间的断点变得相当难以区分。许多临床研究组织
为
ast的标准化方法作了巨大的努力。美国临床试验标准研究所
1971
年提出了clsi的标准化方法,还有后来英国抗菌化疗协会提出
bsac法,欧洲药敏测试委员会提出eucast法等。尽管标准在逐渐完
善和
提高,但前面的路还着实很远。
3、为了解决这个问题,该实验室设计了许多实验,改善ast方法。
根据fibonacci序列分析,他们用细菌浊度的rc作为目标函数,
提
出了ast新方法。这个方法有望发展成为药效学的一种常用方法。
四、研究材料
1、从鸡中分离出来的致病性大肠杆菌e.colicvcc249
2、标准质量控制菌株e.coli25922
五、研究方法
1、用增长序列浊度的rc值描述抗生素的抑制率
细菌细胞分裂的发生是一个随机过程,在任何时候细胞分裂都会
有
一定的比例。一定程度上符合fibonacci序列。但是,浊度仅仅反
映细胞的总数,不能区分分裂和休眠细胞,而一般把细胞分裂用于目
标函数。一般情况下,休眠细胞可以通过浊度的净增加值予以消
除。rc的“无药”起点和“有药”终点可用来确定药物的抑制率。
2、用cfu和浊度的方法测定细菌的生长情况
3、用等高线图显示随着增长率的增加药物浓度和作用时间的效果
等高线图是非线性回归基础上的非建模分析方法,可用来进行两
个
变量间的复杂分析。半乳糖苷酶可用来反映浓度和作用时间对酶
催
化的综合效应。
4、用auc描述“用药”和“不用药”条件下细菌的增殖
一个单点的吸收光谱曲线可以反映一个系统所有因素的影响,然
而
波长间隔可以在很大
程度上影响实验误差,而波长间隔越大,误差越小。因此,若用
auc法对最初和最终的波长下的吸光度进行积分,则得到的结果
误差会较小。相比经典的吸光度方法,auc法更准确,可用它来减少
只选择单一波长为目标函数所造成的误差。
5、用savitzky-golay样条估计平滑观察值
rc对误差非常敏感,在某些情况下递归曲线反映会类似于瞬时生
长
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