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一、细菌的分类的原则
二、细菌的分类鉴定的依据和方法
三、生物的分类系统
;;微生物分类学;第一节细菌分类和鉴定;第一节细菌分类和鉴定;种(species):是一个基本分类单位;是一大群表型特征高度相似、亲缘关系极其接近,与同属内其他种有明显差别的一大群菌株的总称。;模式种:
在微生物中,一个种只能用该种内的一个典型菌株(typestrain)当其具体代表,此即该种的模式种(typespecies)。
例如:
两歧双歧杆菌的大量菌株中,只有“ATCC29521”菌株才是模式种
;亚种(subspecies)或变种(variety):
——种内细分时所用单元。
当某一个种内的某一菌株存在少数明显而稳定的变异特征与模式种不同,而此差异又不足以当作命名新种的依据时,可以将这些菌株细分成小的分类单元——亚种。
变种是亚种的同义词,因“变种”一词易引起词义上的混淆,从1976年后,已废除使用变种一词。
如:E.colik12(野生型)培养时是不需要添加氨基酸的,而实验室变异后,可从k12菌株获得某种氨基酸的缺陷型菌株,此即E.colik12的一个亚种。;;例1:大肠埃希氏菌(简称大肠杆菌)
Escherichiacoli(Migula)CastellanietChalmers1919
例2:枯草芽孢杆(简称枯草杆菌)
Bacillussubtilis(Ehrenberg)Cohn1872;菌株名称——在种名后面自行加上数字、地名或符号等,如:
BacillussubtilisAS1.389AS=AcademiaSinica(中国科学院)
BacillussubtilisBF7658BF=北纺(北京纺织工业局科学研究所)
ClostridiumacetobutylicumATCC824丙酮丁醇梭菌
ATCC=AmericanTypeCultureCollection美国模式菌种保藏中心
当文章中前面已出现过某学名时,后面的可将其属名缩写成1~3个字母。
如:Escherichiacoli可缩写成E.coli
Staphylococcusaureus可缩写成S.aureus
;关于微生物的新种——新分离到并鉴定过的、从未记载过的微生物;2)三名法
用于对亚种的命名,这时在属名和种名后加写一个subsp.,然后再附上亚种名称(斜排体)。;例1:苏云金芽孢杆菌蜡螟亚种
Bacillusthuringiensis(subsp)galleria
例2:椭圆酿酒酵母(或酿酒酵母椭圆变种)
Saccharomycescerevisiae(var)ellipsoideus;第一节细菌分类和鉴定;(一)经典方法(依据细菌形态??细胞结构、生理生化特性);;第一节细菌的分类与鉴定;球菌的分裂方式;金黄色葡萄球菌,常可造成疖、丘疹、肺炎、脊髓炎、心脏炎、脑膜炎及关节炎等化脓性感染,有时产生肠毒素,导致食物中毒等;梭状芽孢杆菌;;枯草芽孢杆菌;铜绿假单胞菌
(绿脓杆菌);结核分枝杆菌;炭疽病的病原菌
-------炭疽杆菌;;
干酪螺菌
;第一节细菌的分类与鉴定;第一节细菌的分类与鉴定;与细菌鉴定有关的细胞结构:
细胞壁芽孢荚膜鞭毛内含物
细胞结构的光学鉴定方法:染色
革兰氏染色法
芽孢染色法
荚膜染色法
鞭毛染色法;;第一节细菌的分类与鉴定;第一节细菌的分类与鉴定;第一节细菌的分类与鉴定;菌落特征:大小、形状、隆起形状、边缘和表面状况、颜色、黏度、硬度、透明度等。;;2.细菌的群体形态
(1)菌落形态
菌落的大小(mm)
形状:
隆起形状:
边缘:
;菌落特征是细菌分类鉴定中
的重要形态指标;2、细胞的群体形态(菌落形态、斜面菌苔、液体培养形态)
(2)菌苔:在斜面培养基上划线接种,培养3-5天形成的培养物。;2、细胞的群体形态(菌落形态、斜面菌苔、液体培养形态)
(3)液体培养:培养1-3天后,观察液体培养基表面生长状态;细菌菌落的共同特征;常用的细菌鉴定的生化试验
氧化酶
接触酶
葡萄糖氧化
糖发酵;3.细胞的生理生化反应
(1)API细菌数值鉴定系统;(2)Biolog全自动细菌鉴定系统
;4、细菌的生态条件;第一节细菌的分类与鉴定;第一节细菌的分类与鉴定;2、核酸杂交;3、16SrRNA碱基测序(
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