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生物技术进展
生物技术进展2024年第14卷第1期160~171CurrentBiotechnologyISSN2095?2341
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基于网络药理学和实验验证探究糖肾宝复方治疗糖尿病肾病的作用机制
苏芳林1,罗鑫1,唐赛男1,黄乐韵1,胡维2,3,陆世龙2,3,冉龙娇2,3,向少伟2,3*
1.广西中医药大学研究生院,南宁530200;
2.广西中医药大学附属瑞康医院肾内科,南宁530011;
3.广西中西医结合肾脏疾病临床医学研究中心,南宁530011
摘要:网络药理学方法结合分子生物学实验探究糖肾宝复方(Tangshenbaocompound,TSB)治疗糖尿病肾病(diabeticnephropathy,DN)的作用机制。使用TCMSP、Pubchem、SwissTargetPrediction数据库,结合相关文献,得到TSB相关活性成分与靶点;通过GeneCards、DisGeNET、OMIM数据库,获得TSB治疗DN候选靶点;利用在线作图软件绘制“TSB-DN”候选靶点Venn图,并结合Cytoscape3.7.2软件进行GO和KEGG富集分析;然后使用PyMOL、AutoDockTools和AutoDockVina软件完成活性成分配体与靶蛋白晶体结构对接;再通过体外培养小鼠肾小球系膜细胞Mcs进行细胞实验验证,实时荧光定量PCR检测各组细胞中STAT3、PIK3CD、PIK3R1、MAPK8及关联性靶点Ets-1mRNA表达水平, CCK-8法检测24h后的细胞活性。结果发现,SwissTargetPrediction数据库合并处理后共获得TSB作用靶点835个,联合GeneCards、DisGeNET、OMIM等疾病数据库后共获得443个“TSB-DN”交集靶点,而PPI网络分析得出Degree前10靶点分别为SRC、PIK3R1、STAT3、PIK3CA等;GO、KEGG富集分析结果显示TSB治疗DN可能与蛋白磷酸化、细胞信号转导、基因表达正调控等功能相关;最后体外细胞实验表明,TSB复方能有效降低SV40-MES-13细胞中PIK3CD、PIK3R1、 ETS-1的mRNA表达量,药物作用于细胞后能起到“抑制、镇静”的作用。结果表明,TSB复方可通过抑制PIK3R1、 PIK3CD和MAPK8、STAT3、ETS-1等靶基因的mRNA表达,实现对PI3K-Akt、AGE-RAGE等信号通路的调控并发挥对 DN的治疗作用。
关键词:网络药理;糖尿病肾病;糖肾宝复方;肾小球系膜细胞DOI:10.19586/j.2095?2341.2023.0142
中图分类号:Q291,R285文献标志码:A
TheMechanismResearchofTangshenbaoCompoundinTreatingDiabeticNephropathyBasedonNetworkPharmacologyandExperimentalVerification
SUFanglin1,LUOXin1,TANGSainan1,HUANGLeyun1,HUWei2,3,LUShilong2,3,RANLongjiao2,3,XIANGShaowei2,3*
1.GraduateSchoolofGuangxiUniversityofTraditionalChineseMedicine,Nanning530200,China;
2.DepartmentofNephrology,RuikangHospitalAffiliatedtoGuangxiUniversityofTraditionalChineseMedicine,Nanning530011,China;3.GuangxiClinicalResearchCenterofKidneyDiseasesofIntegratedTraditionalChineseandWesternMedicine,Nanning530011,
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