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1.写出下列氨基酸的单字母和三字母的缩写符号:精氨酸、天冬氨酸、谷氨酰氨、谷氨酸、苯丙氨酸、色氨酸和酪氨酸。
2、根据p7表1-4中氨基酸的pKa值,计算下列氨基酸的pI值:丙氨酸、半胱氨酸、谷氨酸和精氨酸。
3、一个四肽,经胰蛋白酶水解得两个片段,一个片段在280nm附近有强的光吸收,并且Pauly反应和坂口反应(检测胍基的)呈阳性。另一片段用溴化氰处理(溴化氰专一断裂Met残基的羧基参加形成的肽键)释放出一个与茚三酮反应呈黄色的氨基酸。写出此四肽的氨基酸序列。[YRMP]
;4、计算:
(1)一个含有78个氨基酸的α螺旋的轴长。
(2)此多肽的α螺旋完全伸展时多长?[11.7nm;34.01nm]
5、请分别举例说明蛋白质一级结构、空间构象与功能之间的关系。
;1.写出下列氨基酸的单字母和三字母的缩写符号:精氨酸、天冬氨酸、谷氨酰氨、谷氨酸、苯丙氨酸、色氨酸和酪氨酸。
;2、根据p7表1-4中氨基酸的pKa值,计算下列氨基酸的pI值:丙氨酸、半胱氨酸、谷氨酸和精氨酸。;3、一个四肽,经胰蛋白酶水解得两个片段,一个片段在280nm附近有强的光吸收,并且Pauly反应和坂口反应(检测胍基的)呈阳性。另一片段用溴化氰处理(溴化氰专一断裂Met残基的羧基参加形成的肽键)释放出一个与茚三酮反应呈黄色的氨基酸。写出此四肽的氨基酸序列。[YRMP]
;解:
胰蛋白酶酶专一水解Lys和Arg残基的羧基参与形成的肽键,故该四肽中含Lys或Arg;
一肽段在280nm附近有强光吸收且Pauly反应和坂口反应(检测胍基的)呈阳性,说明该肽段含Tyr和Arg;
溴化氰专一断裂Met残基的羧基参加形成的肽键,又因生成了与茚三酮反应呈黄色的氨基酸,故该肽段为-Met-Pro-;
所以该四肽的氨基酸组成为Tyr-Arg-Met-Pro,即YRMP。
;4、计算:
(1)一个含有78个氨基酸的α螺旋的轴长。(2)此多肽的α螺旋完全伸展时多长?[11.7nm;34.01nm];解:
(1)α螺旋中每个残基绕轴旋转100°,沿轴上升0.15nm,故该α螺旋的轴长为:
78×0.15nm=11.7nm
(2)α螺旋每圈螺旋占3.6个氨基酸残基,故该α螺旋圈数为:78÷3.6圈;
α螺旋的直径约为0.5nm,故每圈轴长为0.5πnm。完全伸展的α螺旋长度约为:
0.5π×(78÷3.6)≌34.01nm。
;5、请分别举例说明蛋白质一级结构、空间构象与功能之间的关系。;提示:
一级结构与功能的关系:镰刀形细胞贫血症
空间构象与功能的关系:血红蛋白与氧的结合
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