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17第十六章RNA的生物合成-图文
第十六章RNA的生物合成
1961年S.B.Wei和J.Hurwitz等各自在大肠杆菌裂解液中发现了DNA依赖的RNA聚合酶(DNA-dependentRNApolymerae,RNApol)。在此之前S.Ochoa已经提出了RNA的转录机制,并因此获得1959年度诺贝尔生理/医学奖。
生物体以DNA为模板合成RNA的过程称为转录(trancription),意指将DNA的碱基序列转抄为RNA。DNA分子上的遗传信息是决定蛋白质氨基酸序列的原始模板,mRNA是蛋白质合成的直接模板。通过RNA的生物合成,遗传信息从染色体的贮存状态转送至胞质,从功能上衔接DNA和蛋白质这两种生物大分子。1958年,F.Crick将上述遗传信息的传递方式归纳为中心法则(centraldogma)。1970年H.Temin发现了逆转录现象,对中心法则进行了补充。
在生物界,RNA合成有两种方式。一是DNA指导的RNA合成,也称转录,为生物体内的主要合成方式。转录产物除mRNA,rRNA和tRNA外,在真核细胞内还有nRNA,miRNA等非编码RNA。对RNA转录过程的调节可以导致蛋白质合成速率的改变,并由此而引发一系列细胞功能变化。因此,理解转录机制对于认识许多生物学现象和医学问题具有重要意义。mRNA转录过程及其加工和剪切错误可引起疾病。RNA的转录合成是本章的主要内容。
另一种是RNA依赖的RNA合成(RNA-dependentRNAynthei),也称RNA复制(RNArep-lication),由RNA依赖的RNA聚合酶(RNA-dependentRNApolymerae)催化,常见于病毒,是逆转录病毒以外的RNA病毒在宿主细胞以病毒的单链RNA为模板合成RNA的方式,限于篇幅本章未予叙述。
转录和复制都是酶促的核昔酸聚合过程,有许多相似之处。它们都以DNA为模板;都需依赖DNA的聚合酶;聚合过程都是核昔酸之间生成磷酸二醋键;都从5’向3’方向延长聚核昔酸链;都遵从碱基配对规律。但相似之中又有区别(表16-1)。
第一节原核生物转录的模板和酶
RNA的生物合成属于酶促反应,反应体系中需要DNA模板,NTP,RNApol,其他蛋白因子及Mg2+和Mn2+等。合成方向5→3,核昔酸间的连接方式为3,5一磷酸二酯键。
312
第十六章RNA的生物合成313
一、原核生物转录的模板
在DNA分子双链上,按碱基配对规律能指导转录生成RNA的一股链作为模板指导转录,另一股链则不转录,这种模板选择性称为不对称转录(aymmetrictrancription)。用RNA对DNA的核酸杂交法(见第二十章)或做DNA、RNA碱基序列测定比较,都可证明DNA分子上的一个基因只有一股链可转录生成其编码产物(图16-1a)。
作为一个基因载体的一段DNA双链片段,转录时作为RNA合成模板的一股单链称为模板链(templatetrand),相对应的另一股单链被称为编码链(codingtrand)。转录产物若是mRNA,则可用作翻译的模板,决定蛋白质的氨基酸序列(图16-lb)。模板链既与编码链互补,又与mRNA互补,可见mRNA的碱基序列除用U代替T外,与编码链是一致的。文献刊出的各个基因的碱基序列,为避免烦琐和便于查对遗传密码,一般只写出编码链。
二、RNA聚合酶催化RNA合成
(一)RNA聚合酶能从头启动RNA链的合成
DNA依赖的RNApol催化RNA的转录合成。该反应以DNA为模板,以ATP、GTP、UTP和CTP为原料,还需要Mg2+和Zn2+作为辅基。RNA合成的化学机制与DNA的复制合成相似。RNApol通过在RNA的3-OH端加入核苷酸,延长RNA链而合成RNA.。3-OH在反应中是亲核基团,攻击进入的核苷三磷酸的α-磷酸,并释放出焦磷酸,总的反应可以表示为:(NMP)n+NTP→(NMP)n+1+PPi。
RNA聚合酶和双链DNA结合时活性最高,但是只以双链DNA中的一股DNA链为模板。新加入的核苷酸以Waton-Crick碱基配对原则和模板的碱基互补。
前述的DNA聚合酶在启动DNA链延长时需要RNA引物存在,而RNA聚合酶能够直接启动转录起点处的两个核苷酸间形成磷酸二酯键(图16-2),因而RNA链的起始合成不需要引物。
(二)RNA聚合酶由多个亚基组成
大肠杆菌(E.coli)的RNA聚合酶是目前研究得比较透彻的分子。这是一个分子量达480kDa,由4种亚基α2(2个α)、β、β’和σ组成的五聚体蛋白质。有证据表明,大肠杆菌RNA聚合酶还有第五种亚基(w亚基)存在,其功能不详,本章不予赘述。其他各主要亚基及功能见表16-2。
314第三篇遗传信息的传递
大肠杆菌RNApol的4个主要亚基(α2ββ’)称为核心酶
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