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大豆IGT基因家族的全基因组鉴定及组织表达分析
目录
一、内容概括................................................3
1.研究背景与意义........................................4
2.IGT基因家族简介.......................................4
3.研究目的与内容........................................5
二、材料与方法..............................................6
1.材料来源..............................................7
大豆基因组数据.........................................7
IGT基因家族成员........................................8
2.研究方法.............................................10
全基因组鉴定..........................................10
组织表达分析..........................................11
数据处理与分析........................................12
三、大豆IGT基因家族的全基因组鉴定..........................13
1.IGT基因家族成员的筛选与鉴定..........................14
基因组数据比对........................................15
IGT基因家族成员的确定.................................16
2.功能注释与特征分析...................................17
功能域预测............................................18
基因结构分析..........................................20
信号肽与跨膜区预测....................................21
3.IGT基因家族的系统发育关系分析........................22
核苷酸序列相似性分析..................................23
蛋白质序列相似性分析..................................23
系统发育树构建........................................24
四、大豆IGT基因家族的组织表达分析..........................26
1.不同组织中IGT基因家族成员的表达模式..................27
叶部组织..............................................28
茎部组织..............................................29
根部组织..............................................30
花部组织..............................................32
2.不同发育阶段中IGT基因家族成员的表达模式..............33
萌芽期................................................34
生长中期..............................................35
成熟期................................................36
3.IGT基因家族成员在不同组织及发育阶段的表达差异分析....37
表达量差异............................................38
表达模式差异..........................................39
五、结论与讨
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