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生物技术进展
生物技术进展2023年第13卷第5期807~817CurrentBiotechnologyISSN2095?2341
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基于网络药理学和分子对接探讨金银花口服液防治新型冠状病毒感染的作用机制
柯昌虎1,2,吴亚晴2,丁雪茹1,黄慧敏1,严慧1*
1.湖北医药学院附属国药东风总医院,湖北十堰442008;2.湖北医药学院药学院,湖北十堰442000
摘要:利用网络药理学和分子对接探讨金银花口服液防治新型冠状病毒感染的分子机制。通过中药系统药理学数据库与分析平台(traditionalChinesemedicinesystemspharmacologydatabaseandanalysisplatform,TCMSP)检索药物的化学成分,借助SwissTargetPrediction数据获取药物成分对应的相关靶点;在GeneCards、CTD、TTD、DrugBank数据库中检索疾病的相关靶点;利用Venny2.1.0在线软件获取药物与疾病的共同靶点;由Cytoscape3.8.2绘制药物-成分-靶点-疾病网络;String数据库构建蛋白互作网络;借助David数据库进行基因本体论(geneontology,GO)功能富集和京都基因和基因组百科全书(kyotoencyclopediaofgenesandgenomes,KEGG)通路富集分析;运用AutoDock软件对成分和靶点进行分子对接验证。结果发现,金银花口服液中16个有效成分通过调控88个靶点和108条通路对新型冠状病毒感染产生作用,伞房花耳草素、金圣草素、木犀草素、亚油酸乙酯、山奈酚、槲皮素等成分可以通过AKT1、SRC、EGFR、HIF1A、PPARG、MMP9、ESR1、MAPK1、PTGS2、MMP2等关键靶点调控HIF-1、化学致癌-受体激活、内分泌抵抗、粘着斑、PI3K-Akt、VEGF、松弛素、ErbB、丙型肝炎、乙型肝炎、Rap1等信号通路来治疗新型冠状病毒感染。分子对接结果显示,靶点蛋白与活性成分具有较好的结合能力。结果表明,金银花口服液可以通过多成分、多靶点、多途径参与新型冠状病毒感染的防治,这为其临床应用及深入研究防治新型冠状病毒感染的机制提供了理论依据。
关键词:金银花口服液;新型冠状病毒感染;网络药理学;分子对接;作用机制DOI:10.19586/j.2095?2341.2023.0052
中图分类号:Q939.47,R285文献标志码:A
ResearchontheMechanismofJinyinhuaOralLiquidinthePreventionandTreatmentofCOVID-19BasedonNetworkPharmacologyandMolecularDocking
KEChanghu1,2,WUYaqing2,DINGXueru1,HUANGHuimin1,YANHui1*1.SinopharmDongfengGeneralHospital,HubeiUniversityofMedicine,HubeiShiyan442008,China;
2.SchoolofPharmacy,HubeiUniversityofMedicine,HubeiShiyan442000,China
Abstract:TopredictthemechanismofJinyinhuaoralliquidinthepreventionandtreatmentofcoronavirusdisease2019(COV?ID-19)basedonnetworkpharmacologyandmoleculardocking.ThechemicalingredientsofdrugswerecollectedbytraditionalChinesemedicinesystemspharmacologydatabaseandanalysisplatform(TCMSP),whileSwissTargetPredictionwereusedtopredictthecorresponding
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