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**不是所有基因都含有TATA盒或Inr序列.有的只有其中之一,有的两者都无.**GC-box可以有多拷贝CAAT可在更远处对转录起始的效率影响很大**CAAT(-80)可在更远处,任意方向起作用.但似乎不直接影响启动的特异性.位置和方向以起始点为参照.GC-box(-40至70)也是常见的启动子元件.可在任意反向作用.可以有多拷贝.启动子中含有多种上游元件,但是没有哪一种是所有启动子所共同必需的.GC,CAAT本身不对称,但可以在任意方向作用.虽然,转录只能向下游方向进行.原理尚不清楚.组件特性--可互换组合(例,胸苷基酶和珠蛋白启动子部分融合),不影响功能.表明其功能为将蛋白质因子带到起始点区域,转录效率取决于蛋白因子的互作.**构成功能性启动子的元件多样性和相对于起始位点的位置变化表明,转录因子能以多种方式通过蛋白质-蛋白质相互作用而彼此相互作用**目前发现的所有DNA结合蛋白都是结合大沟,但TBP却能与小沟结合TBP内面与DNA结合,较大的外面可与其他蛋白质结合TFIIF ——结合PolII并带向启动子;RAP74(ATP依赖性解旋酶),RAP30(与细菌?因子有同源性)TFIIE ——扩大DNA覆盖区至+30TFIIH和TFIIJ ——H有激酶活性,使PolII的CTD磷酸化,PolⅡ离开启动子区第32页,共47页,星期六,2024年,6月(1)TFIID:TBP(TATA盒结合蛋白)+TAFs(TBP协同因子)TBPTAFsTATA-20-10+10-30-40+20(四)RNAPolⅡ基因转录的过程1、转录起始第33页,共47页,星期六,2024年,6月TBP的作用----定位因子a、在TATA框处与DNA结合b、是所有三种RNA聚合酶转录起始所需的因子第34页,共47页,星期六,2024年,6月TBP的作用机制:a、两个结构域形成一个完全二元对称的马鞍型结构,与DNA小沟有效结合第35页,共47页,星期六,2024年,6月b、TBP与DNA结合,使DNA弯曲了约80°,TATA盒向大沟弯曲,拓宽了小沟。第36页,共47页,星期六,2024年,6月(2)TFIIA含有至少3个亚基与TFIID结合,稳定TFIID-DNA复合体;可能通过解除TAFs的抑制而激活TBPTFIIA第37页,共47页,星期六,2024年,6月(3)TFIIB覆盖靠近起始点的启动位置,C端与TFIID和DNA的复合物结合,N-端与TFⅡF协同作用募集RNA聚合酶IITFIIB与TFIID结合,并为RNA聚合酶结合起一个桥梁作用。TFIIB第38页,共47页,星期六,2024年,6月(4)与RNA聚合酶与TFIIF相连的复合体结合TFIIFPolIITFIIF结合PolII并带向启动子;两个亚基:RAP74(ATP依赖性解旋酶),可能参与DNA双链的溶解RAP30(与细菌?因子有同源性),与RNA聚合酶Ⅱ紧密结合第39页,共47页,星期六,2024年,6月(5)TFIIE 扩大DNA覆盖区至+30TFIIE第40页,共47页,星期六,2024年,6月(6)TFIIH和TFIIJ加入复合物第41页,共47页,星期六,2024年,6月(7)TFIIH有多种酶活性,包括ATP酶、解旋酶、和可使PolII的CTD磷酸化的激酶活性。PolII的CTD磷酸化,TFII在PolⅡ离开启动子前释放,形成适于延伸的构象PolII离开启动子区,进入延伸阶段第42页,共47页,星期六,2024年,6月RNA聚合酶Ⅱ起始复合物的组装启动子TATA盒+TFⅡD+TFⅡA+TFⅡB+(RNA聚合酶+TFⅡF)复合物+TFⅡE、TFⅡJ+TFⅡH(解旋酶、蛋白激酶)DNA解旋、RNA聚合酶Ⅱ的CTD磷酸化polⅡ从转录因子中释放出来从起始点向下游移动第43页,共47页
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