0 片段分析软件GeneMapper v3.0中文操作手册.pdf

美国应用生物系统公司

片段分析和基因分型软件

GeneMappetv3.0

中文操作于册

(仅供参考，请阅读英文原版手册、)-Applied

技术服务部，2004年Biosystems

对关EEv3.0:文革岂

概述3

ABIPRISMeGENEMAPPERV3.0中文手册.LMS..

一开机

二.输入PANEL

三.生碟BIN

四,定义ANALYSISMETHOD

五.设置默认值

六.分析数据

七.编辑结果

八，创建自己的KT、PANE和MARKER

ABIPRISMeGENEMAPPER7DV3.1中文手册，HID.ee7

一.安装及登录7

二.设置参数了7

三.分析数据8

四.输出结果9

ABIPRISMSGENEMAPPERV3.0中文手册SNPs10

一-开机10

分析片段大小证

.将兰下已”四也如同说愉过再于010

.定义BIN和MARKER10

.闪闪名加加多操守口区习史出骨时各于…写0

六.分析数据1

七，编辑结果17

八.自动生成PANEL17

人ABIPrismGeneMappery3.0中文王遇

概述

GeneMapper是高通{全蝇动的DNA片段分析和基因分型软件,功能上相当于GeneScan、

Genotyper利|Template软件的整合，在应用上分为3类:以微卫星(STR)连锁分析为基础的人

和小鼠全基因纽打描，以单碱基延促《微测序)为基础的SNP分析，和以STR遗传分析为基

础的人、马、牛、羊亲了鉴定及身份认定。其中GeneMapper加v3.1是亲了鉴定的专用软件。

GeneMapper以Project为数据答理单位，Project之下义划分4个层次，从上到下依次为

Kit、Panel(=-BinSeb，、Marker利|Allele人Bin)。对于基因组扫描而言，kit就是LMS-HD5利|

LMS-MD10;对于亲子监定而言,kit是AmpFISTR;对于SNP而言,kit是SNaPshotMultiplex。

Panel是一组Marker。某央组扫描试剂盒将800(HD)或400(MD)个位点组织成28个Panel,每

Panel通常含有十几个同一Panel中的位点基本上位寺同一到两条染色体上;对十亲子

监定应用而言，Pancl就是通常所说的不同位点数目的研剂盒，如16个位点的Identifiler、10

个位点的ProfilerPlus、6个位点的COfiler等;对于SNP侧言则是一次SNaPshotMultiplex实

验所包含的全部位点，如6plex、10plex等等。一个Pane]所包括的全部位点及其等位基因的

定义称为BinSet。Marker就是STR或SNP位点，如D16S539、TH01等。Allele是同一个位

点在人群中的等位基因，SNP位点一般只有两种等位基因，STR位点则可以有几十种等位基

因(当然，对于每个人而言只有最多2种等位基因)。Bin怕当于Allele。记什这些定义，有助

RE

数据分析过