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生物化学及分子生物学实验考试-图文
一、实验原理步骤:1、分子克隆总流程:
分子克隆:在分子水平上提供一种纯化和扩增特定DNA片段的方法。
常含有目的基因,用体外重组方法将它们插入克隆载体,形成重组克隆载体,
通过转化与转导的方式,引入适合的寄主体内得到复制与扩增,然后再从筛
选的寄主细胞内分离提纯所需的克隆载体,可以得到插入DNA的许多拷贝,
从而获得目的基因的扩增。
流程:
(1)带有目的基因的DNA片段的获得——PCR引物设计,PCR获得。
(2)重组DNA分子的构建——与载体酶切连接。
(3)重组DNA分子的转化和重组克隆的筛选——转化,培养,筛选
(4)检测——菌落PCR检测,粗提质粒检测,酶切检测,精提质粒测
序。
2、质粒DNA的提取及鉴定一一碱裂解法
原理:
根据共价闭合环状质粒DNA和线性染色体DNA在拓扑学上的差异来分离
质粒DNA。在pH12.0-12.5,线性的DNA双螺旋结构解开而被变性,尽管在这
样的条件下,质粒DNA的氢键断裂,但两条互补链仍紧密结合。
当加入pH4.8的KAc高盐缓冲液中和pH至中性时,共价闭合环状的质粒
DNA复性迅速而准确,而线性的染色体DNA的两条互补链彼此已完全分开,复
性慢,缠绕形成网状结构。通过离心,染色体DNA与RNA、蛋白质-SDS复合
物等一起絮状沉淀下来而被除去。
步骤:1、细菌培养和收集①将3ml含Kan的LB液体培养基加入到试管
中,接入含质粒的大肠杆菌,37°C振荡培养过夜。(已完成)
②取2.5mL培养物倒入微量离心管(EP管)中,10000rpm离心lmin,
吸去培养液。
2、细菌裂解及质粒的提取
③将细胞沉淀悬浮于100ul溶液I中,充分震荡混匀。④加200ul溶液
II(新鲜配制),盖紧管盖,轻轻混匀内容物,将离心管放冰上5min。⑤加
150ul溶液III(冰上预冷),盖紧管口,轻轻颠倒数次使混匀。冰上放置10min。
⑥12000rpm离心10min,将上清转至另一EP管(作好标记)中。3、质粒的纯
化
⑦向上清中加入等体积(450ul)酚:氯仿(1:1)(注意下层是有机相),
反复混匀。⑧12000rpm,离心2分钟,将上清小心地转移到另一离心管(标
记!)中⑨加入等体积(450ul)氯仿:异戊醇(24:1),反复混匀。⑩12000rpm,
离心2分钟,取上清液于新的EP管中。4、质粒的浓缩①加入2倍体积(900ul)
无水乙醇,混匀后,室温放置10T5min。②12000rpm离心5分钟,倒去上清
液,把离心管倒扣在吸水纸上,吸干液体。③用1ml70%乙醇洗涤质粒DNA沉
淀,振荡并离心,12000rpm离心2分钟,倒去上清
液,空气中干燥5—10min。5、质粒的溶解和保存及电泳检测④加20ulTE
缓冲液,其中含有100ug/ml的胰RNA酶使DNA完全溶解。⑤-20C保存⑥1%
胶,恒压150V,电泳10-20分钟
要点:载体定义:基因工程中携带目的基因进入宿主细胞进行扩增和表
达的工具。
类型:大肠杆菌中的质粒、噬菌体、M13噬菌体、噬菌粒外,还有酵母人
工染色体载体及动、植物病毒载体等。
条件:复制子、咸志梅单一识别位点、标记基因、适合的拷贝数
碱解法、煮沸法(cDNA、pDNA变性、复性不同)
苯酚抽提法(酸性、低离子强度时超螺旋在水相分布)CCl法(EB插入
造成DNA浮力密度不同)
SDS裂解法(高盐浓度下大分子沉淀,质粒在上清)玻璃纤维膜法(试剂
盒)
EDTA螯合Mg离子,抑制DNA酶活性,
3、质粒DNA的酶切鉴定及电泳检测
原理:DNA分子在高于等电点的溶液中带负电荷,在电场中向正极移动。
DNA分子在琼脂糖凝胶中时有电荷效应和分子筛效应。
在一定的电场强度下,DNA分子的迁移速度取决于分子筛效应.具有不同
的相对分子质量的DNA片段泳动速度不一样.凝胶电泳不仅可分离不同分子质
量的DNA,也可以分离分子质量相同,但构型不同的DNA分子。超螺旋》线型》
开环步骤:1、酶切:
无菌ddH2O4ul
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