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J.SHANXIAGRIC,UNIV.(NaturalScienceEdition)
2022,42(2)05604097
学报(自然科学版):
路媛媛,孙承龙,谭玉琴,等.玉蜀黍尾孢菌VelB基因敲除及生物信息学分析[J].山西农业大学学报(自然科学版),2022,
42(2):56-64.
LuYY,SunCL,TanYQ,etal.KnockoutandbioinformaticsanalysisofVelBgeneinCercosporazeae-maydis[J].Journalof
ShanxiAgriculturalUniversity(NaturalScienceEdition),2022,42(2):56-64.
doi:10.13842/ki.issn1671-8151.202111016
玉蜀黍尾孢菌VelB基因敲除及生物信息学分析
12111113*
路媛媛,孙承龙,谭玉琴,魏文杰,史咸春,宋艳波,李丽,刘振宇
(1.山西农业大学生命科学学院,山西太谷030801;2.山西农业大学园艺学院,山西太谷030801;
3.山西农业大学信息科学与工程学院,山西太谷030801)
摘要:[目的]通过对玉蜀黍尾孢菌VelB基因进行生物信息学分析并构建敲除载体,为研究CzVelB调控玉蜀黍尾孢
菌致病性的分子机制奠定基础。[方法]从JGI数据库中获得CzVelB基因序列,对其进行生物信息学分析,包括蛋白质
的性质、保守区域、磷酸化位点、亚细胞定位、跨膜结构域和聚类分析,分析其基因功能。并采用同源互补原理构建
CzVelB基因敲除载体,最终采用农杆菌介导遗传转化技术进行基因敲除。[结果]CzVelB基因编码385AA,预测pI和
MW分别为9.05和42.13645kDa,是亲水性蛋白,无跨膜结构域。在亚细胞水平上,CzVelB定位在细胞核中。在氨
基酸序列方面,具有多个丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸激酶磷酸化位点;在功能上具有2个Velevt的保守结构域,并与As⁃
pergillusflavus、A.niger亲缘关系较近,具有较高同源性。根据CzVelB基因序列设计特异性引物,扩增侧翼片段和标
记基因,分别连入骨架载体pPZP100中,成功构建CzVelB基因的敲除载体,最终利用ATMT技术获得其敲除转化
子。[结论]本文系统研究玉蜀黍尾孢菌VelB基因功能,并成功构建其敲除载体,获得敲除转化子,为后续研究CzVelB
基因功能提供基础材料。
关键词:玉蜀黍尾孢菌;VelB;生物信息学;敲除载体;敲除突变体
中图分类号:S432.1文献标识码:A文章编号:1671-8151(2022)02-0056-09
玉米灰斑病是世界玉米种植区重要真菌性病来,致病学家和化学家研究内容主要集中在尾孢
[5][6]
害之一,其病原菌为玉蜀黍尾孢菌(Cecrosporaze⁃毒素的分离、纯化和化学结构鉴定等方面。目
ae⁃maydisTehonDaniels),属子囊菌门球腔菌[7]
前对尾孢毒素的提取仍采用浓缩浸提法,研究发
属真菌[1]。自1991年首次在我国辽宁丹东地区发现该毒素对寄主保护酶及玉米胚根的生长
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