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ResearchReport
野油菜黄单胞菌BioC蛋白的生物信息学分析
陈群一”吴晓妍”陈博，王海洪1余永红3
1510642;2510642;3，510520
华南农业大学生命科学学院，广州，华南农业大学，群体微生物研宂中心，广州，广东食品药品职业学院，广州
*同等贡献作者
**通信作者,**************.cn
摘要野油菜黄单胞菌ATCC33913基因组中XccO??、Zcc/67S被标注丙二酸单酰-ACP甲基转移酶
(BioC)编码基因，从KEGG数据库检索Xcc0383和Xccl678的氨基酸序列，运用生物信息学在线分析软件对
这2个基因编码的蛋白进行了理化性质、蛋白结构、亲水性、跨膜结构、信号肽、磷酸化位点及蛋白相互作用
网络的预测分析。结果表明2个蛋白理化性质相近，但Xcc0383为亲水性蛋白，Xccl678位疏水性蛋白。2个
蛋白都具有甲基转移酶功能结构域，不存在跨膜结构域和信号肽,磷酸化位点和翻译后修饰位点的数量和位
置类似。Xcc0383和Xcc1678二级结构中组成最多的是ct-螺旋，分别占46.36%和51.69%,三级结构预测结
果与二级结构一致。蛋白相互作用预测后发现，Xcc0383与BioH、BioF、BioA等负责生物素合成的蛋白关系
最为密切，而Xccl678与其毗邻的糖基转移酶关系密切。氨基酸序列同源比对显示Xcc0383与大肠杆菌(£.
C〇Z〇的BioC相似性较高。Xcc0383编码蛋白负责在野油菜黄单胞菌体内合成生物素，而Xccl678作为甲基
转移酶负责为不同的受体分子提供甲基基团。
关键词生物信息学，野油菜黄单胞菌，丙二酸单酰-ACP甲基转移酶，预测分析
BioinformaticsAnalysisofBioCProteinsfromXanthomonascampestrispv.
campestris
ChenQunyi*WuXiaoyan2,ChenBo1WangHaihong1YuYonghong3*.
1Collegeof
turalUniversity,Guangzhou,510642;3GuangdongFoodandDrugVocationalCollege,Guangzhou,510520
*Theseauthorscontributedequallytothiswork
**Correspondingauthor,**************.cn
DOI:10.13417/j.gab.039.005091
AbstractTwogenesinXanthomonascampestrisATCC33913,Xcc0383andXccl678,wereannotatedasmal-
onyl-ACPmethyltransferase.Weanalyzedandpredictedthephysicochemicalproperties,structures,hydrophilicity,
transmembranedomain,signalpeptide,phosphorylationsitesandproteininteractionnetworkofXcc0383and
Xccl678byusingbioinformaticsanalysistool.Theresultsshowedthatthetwoproteinshadsimilarphysicochemi
calproperties,butXcc0383wasahydrophilicprotein,withXccl678ahydrophobicprotein.Transmembranedo
mainandsignalpeptidedidnotexistinbothofthem,andthenumberandlocationofphosphorylationand
post-translationalmodi
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