evaluation of the lasso and elastic net in genome-wide association studies全基因组关联研究中套索弹性网络评估.pdfVIP

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ORIGINALRESEARCHARTICLE

published:04December2013

doi:10.3389/fgene.2013.00270

Evaluationofthelassoandtheelasticnetingenome-wide

associationstudies

PatrikWaldmann1,2,GáborMészáros1,BirgitGredler3,ChristianFuerst4andJohannSölkner1

1DivisionofLivestockSciences,DepartmentofSustainableAgriculturalSystems,UniversityofNaturalResourcesandLifeSciences,Vienna,Austria

2DivisionofStatistics,DepartmentofComputerandInformationScience,LinköpingUniversity,Linköping,Sweden

3QualitasAG,Zug,Switzerland

4ZuchtDataEDV-DienstleistungenGmbH,Vienna,Austria

Editedby:Thenumberofpublicationsperforminggenome-wideassociationstudies(GWAS)

HennerSimianer,Georg-Augusthasincreaseddramatically.Penalizedregressionapproacheshavebeendevelopedto

UniversityGoettingen,Germanyovercomethechallengescausedbythehighdimensionaldata,butthesemethods

Reviewedby:arerelativelynewintheGWASﬁeld.Inthisstudywehavecomparedthestatistical

HennerSimianer,Georg-August

UniversityGoettingen,Germanyperformanceoftwomethods(theleastabsoluteshrinkageandselectionoperator—lasso

ValentinWimmer,Technischeandtheelasticnet)ontwosimulateddatasetsandonerealdatasetfroma50K

UniversitätMünchen,Germanygenome-widesinglenucleo

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