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GAS41基因在海兰褐蛋鸡不同组织中的表达分析
摘要:本研究旨在比较分析GAS41基因在35周龄海兰褐蛋鸡心脏、肝脏、脾脏、盲肠以及空肠等五个组织中的表达水平,为该基因的功能研究奠定基础。本试验以10只35周龄健康海兰褐蛋鸡为研究对象,提取心脏、肝脏、脾脏、盲肠、空肠5个组织RNA,采用实时荧光定量PCR(q-PCR)技术,检测GAS41基因在5个不同组织中的表达水平。结果表明,GAS41基因在35周龄的海兰褐蛋鸡中5个不同组织中均有不同程度的表达,且在不同组织中的表达量存在差异,表达量由高到低依次为:脾脏>空肠>盲肠>肝脏>心脏;其中GAS41在脾脏中的表达量最高,心脏中的表达量最低,两者之间差异极显著(P0.01)。本试验揭示了GAS41基因在35周龄海兰褐蛋鸡不同组织中的表达差异性,为日后进一步的功能分析奠定基础。
关键词:海兰褐;GAS41;基因表达
1引言
GAS41(gliomaamplifiedsequence41,神经胶质瘤扩增序列41)最初是在神经胶质瘤中被发现的。神经胶质瘤简称胶质瘤,也被称为胶质细胞瘤,其是迄今为止在成人中最为常见的恶性脑瘤,大约占所有原发性脑瘤的一半,神经胶质瘤,从广义上讲,是指所有来源于神经上皮的脑肿瘤,而从狭义上讲,则是由不同类型的胶质细胞产生的肿瘤。胶质细胞瘤具有很强的侵袭性和致命性,预后较差,患者通常只有12-15个月的生存期[1]。在早期对神经胶质瘤的研究中,发现该序列在神经胶质瘤中有高频率的扩增现象[2],从而在多形性神经胶质瘤细胞系中分离得到该序列,其因此而得名gliomaamplifiedsequence41[3]。后有研究发现,GAS41在人类的肿瘤中扩增频率非常频繁,在星型细胞瘤的I、Ⅱ、Ⅲ和IV阶段均发现了这段高拷贝的神经胶质瘤扩增序列[4]。
研究发现,GAS41蛋白在人类、黑腹果蝇、鸡以及小鼠中都是一个高度保守的蛋白[5]。GAS41基因已被研究证实位于溶酶菌基因的下游,该基因两侧分别有两个基质附着区(MARs)[6]。GAS41基因的启动子与一个CpG岛共定位,
CpG岛也可以作为复制的起点。有研究表明,GAS41基因的启动子中包含几个潜在的Myb结合位点(MBSs),因此GAS41基因是v-Myb的直接靶基因[7]。相关研究发现,GAS41基因可能与细胞的生长和存活有密切的联系[4],其对细胞活力的影响是不容忽视的。GAS41蛋白一共包括227个氨基酸,在这段蛋白的N端含有一个特殊的YEATS结构域。由于许多染色质修饰和转录调控的复合体都含有YEATS蛋白,而许多编码YEATS蛋白的基因都参与了染色质修饰和转录调控的过程,所以GAS41蛋白很有可能以一种独特的方式,在染色质修饰和转录调控的过程中发挥着某些重要作用。
研究发现,GAS41基因在人类和鸡中广泛表达。GAS41基因泛素化表达于人类组织细胞核中,其中GAS41在人脑中表达量最高,该基因可能在人脑中起功能作用。GAS41基因在鸡的前淋巴细胞系DT40中定点敲除后,细胞中的RNA合成大量降低,细胞随后死亡[4]。由此可见,GAS41是一个重要的管家基因,决定细胞的生长与存活。此外,GAS41与人类急性白血病融合蛋白MLL-AF相互作用,该融合蛋白在5-10%的人急性白血病中检测到,因此GAS41的过表达与人类血液的恶性转化有一定的联系[8]。GAS41与通用转录因子复合体成员TFIIF相互作用,和特异的转录因子AP-
2beta也相互作用,促进RNA转录从而参与基因的转录调控[17][12]。此外,人的GAS41蛋白还能与NuMA相结合[18]。最近的研究发现GAS41与磷酸酶PP2Cbeta相互作用,促进了肿瘤抑制基因P53的去磷酸化,进而抑制肿瘤抑制基因P53信号通道[16]。还有研究发现,GAS41可能与MDM2一起在脂肪肉瘤的形成中起重要作用。因此,GAS41在细胞增殖与肿瘤发生发展中起重要的转录调控作用。
1.1GAS41基因
通过对NCBI的gene数据库的检索,可以获得GAS41基因的相关信息。通过对GAS41基因序列的同源检索,我们可以发现GAS41基因还有其他命名,其中GAS41(gliomaamplifiedsequence41)和YEATS4(YEATdomaincontaining
4)最为常见。通过检索,我们可以得到鸡GAS41基因(Yeats4基因)的相关信息如下,其蛋白质登录号为
NP_001072971.1,核酸登录号为NM_001079503.1。GAS41基因cDNA序列为1103bp,基因编码框全长684bp,编码227个氨基酸。
由在NCBI的Ge
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