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膜蛋白纯化解决方案
膜蛋白是一种位于细胞膜上的蛋白,主要分为外周膜蛋白和跨膜
蛋白两大类。膜蛋白具有重要的生物功能,如控制能量转换、参与信
号转导、控制物质运输、维持细胞和组织结构等,因此膜蛋白一直是
研究热门,是当前近70%的药物靶标。
想要研究更具体膜蛋白结构或者功能特性,我们首先要提取纯化
相应的膜蛋白。接下来以一篇经典Nature文章为例,解析如何提取纯
化膜蛋白。
2019年Nature文章:人的Tcellreceptor–CD3复合体结构研
究
纯化思路:
(1)重组蛋白的构建:
以哺乳细胞HEK293F为表达宿主,在C末端依次加了Strep和
His标签。
目的基因:TCRα,TCRβ(pCAG)+CD3γ、δ、ε、ζ
(pcDNA3,4)。
(2)重组蛋白的诱导表达:
在37℃、含有5%CO2条件下,120rpm培养60h。
(3)细胞膜结构的制备和溶解:
通过离心收集细胞,然后匀浆破碎。
细胞膜结构组份的收集:用25mMHEPES,pH7.5,1MNaCl缓
冲溶液重悬,加入1mMPMSF,100,000g超速离心30min收集细
胞膜结构组份。
细胞膜结构的溶解:用25mMHEPES,pH7.5,150mMNaCl,
1%DDM,0.2%cholesterylhemisuccinatetrissalt,1mMPMSF,
4℃条件下溶解2h。
40,000g离心30min,收集上清,即为可溶的膜蛋白粗溶液。
(4)亲和层析纯化:
本文作者用StrepTactin填料进行纯化。
结合条件:4℃结合3h;
Washbuffer:25mMHEPES,pH7.5,300mMNaCl,0.06%
digitonin;
Elutionbuffer:25mMHEPES,pH7.5,150mMNaCl,0.06%
digitonin+4mMdesthiobiotin
图1亲和层析后,各个亚基的SDS图
(5)膜蛋白复合体交联
蛋白质浓缩后用0.1%(v/v)的戊二醛交联40min,得到膜蛋白复合
体。
(6)凝胶过滤分子筛层析:
用Superose6increase10/300,buffer为25mMHEPES,pH
7.5,150mMNaCl,0.06%digitonin
图2TCR-CD3复合体SDS图
膜蛋白复合体TCR-CD3交联后进行凝胶过滤分子筛层析,进行
SDS实验,发现得到比较纯的复合体。
(7)TCR-CD3结构分析
通过冷冻电镜分析,TCR–CD3复合物的最终原子模型包含全长
TCRαβ的亚基,完整的ECD和跨膜螺旋CD3γε,CD3δε和CD3ζζ
图3TCR–CD3复合体结构图
看完大佬的实验框架,是不是顿时对自己的实验也有了一些思路?
总结一下,膜蛋白的一般研究流程:
蓝色背景分别是表达系统与去垢剂的选择,是整个流程中至关重
要的步骤。
膜蛋白的表达系统:原核表达(大肠杆菌、红杆菌属)、哺乳细
胞(HEK293F)、酵母表达、昆虫细胞表达。不同的表达系统的优缺
点见下图。
去垢剂的选择:去垢剂别名表面活性剂、乳化剂、肥皂等等,分
为离子型、非离子型和两性离子型三类。去垢剂是同时具有亲水性和
疏水性基团的双极性分子,能够使磷脂双分子层解体并释放膜蛋白,
并且为去膜状态下的膜蛋白提供稳定的疏水环境。去垢剂也需要筛选
合适的种类和浓度,各自优缺点见下图。
蛋白纯化:使用亲和+凝胶过滤(分子筛)即可完成膜
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