TGXTC-基于转录组测序的菠萝蜜抗寒基因挖掘技术规范.pdf

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GXTC

团体标准

T/XXXXXXX—2023

基于转录组测序的菠萝蜜抗寒基因挖掘技

术规范

SpecificationforminingcoldresistancegenesofArtocarpusheterophyllusbasedon

transcriptomesequencing

（征求意见稿）

（本草案完成时间：2023年5月3日）

在提交反馈意见时，请将您知道的相关专利连同支持性文件一并附上。

2022-XX-XX发布XXXX-XX-XX实施

广西热带作物学会  发布

T/XXXXXXX—2023

目录

前言错误！未定义书签。

1范围1

2规范性引用文件1

3术语和定义1

4原理2

5仪器设备及试剂2

6品种选择与使用2

7转录组测序流程3

8生物信息学分析3

I

T/XXXXXXX—2023

前言

本文件按照GB/T1.1—2020《标准化工作导则第1部分：标准化文件的结构和起草规则》的规定

起草。

请注意本文件的某些内容可能涉及专利。本文件的发布机构不承担识别专利的责任。

本文件由广西壮族自治区亚热带作物研究所提出。

本文件由广西热带作物学会归口。

本文件起草单位：广西壮族自治区亚热带作物研究所

本文件主要起草人：杜英俊、朱鹏锦、唐秀观、钟云婕、何江、欧景莉、叶维雁

II

T/XXXXXXX—2023

基于转录组测序的菠萝蜜抗寒基因挖掘技术规范

1范围

本文件确立了基于转录组测序的菠萝蜜抗寒基因挖掘的试验方法、数据分析的标准。本标准主要

技术内容包括试验品种选择与使用、转录组测序流程（RNA提取、RNA检测、文库构建、文库质检、

上机测序）、生物信息学分析（测序数据及质量控制、转录本拼接、基因功能注释、CDS预测、基因

表达定量、差异基因筛选、差异表达基因功能注释和富集分析、转录因子注释）。

本标准适用于通过对不同耐寒性品种的菠萝蜜（Artocarpusheterophyllus）进行转录组测序，筛选

菠萝蜜抗寒基因。

2规范性引用文件

下列文件中的内容通过文中的规范性引用而构成本