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引物套装(探针法)操作说明
一、试剂组成及配制
试剂
纯化方式
净含量
溶液配制
RTPrimer(特异性逆转录引物)
PAGE
粉剂1nmol×1支
在管中加入100μLRNase-freeH2O配制成10μM储存液
PCRPrimerset(PCR引物对)
PAGE
粉剂2nmol×1支
在管中加入200μLRNase-freeH2O配制成10μM储存液
TaqManprobe(探针)
HPLC
在管中加入100μLRNase-freeH2O配制成10μM储存液
RNase-freeH2O(去RNA酶水)
液体1.5mL×1支
备注:
干粉剂溶解前,10000r/min,离心15~30s,将干粉离心于管底。引物溶液4℃短期储存,长期保存置于-20℃,可保存6个月。
二、操作步骤
1.基因特异性逆转录反应体系的制备
A在无RNase的离心管中混合下列试剂进行预变性
试剂
终浓度
加量/孔
RTprimer(1μM)
60nM
1.2μL
RNASample
1μg
2μL
B加热70℃,5min后,马上置于冰盒上*
C按照下表提供的20μL逆转录反应体系混合其他试剂
试剂
终浓度
加量/孔
5×MMLVRTBuffer
1×
4μL
dNTP(10mM)
0.375mM
0.75μL
RNasin(40U/μL)(可选*)
0.5U/μL
0.25μL
MMLVReverseTranscriptase(200U/μL)
40U
0.2μL
RNase-freeH2O
To20μL
D运行mRNA逆转录程序:42℃45min,85℃5min,4℃保存
运行miRNA逆转录程序:26℃40min,42℃40min,85℃10min,4℃保存注*:根据用户具体需求,步骤B可选择省略;RNasin为非必需试剂,请客户自备。
2.探针法定量PCR20μL反应加样量体系[1,2]
试剂
终浓度
加量/孔
2×Real-timePCRMasterMix(FAM)
1×
10μL
PCRPrimerset(10μM)
0.2μM
0.4μL
TaqManProbe(10μM)
0.1μM-0.2μM
0.2μL-0.4μL
ROXreferencedye(50×)(依据机器型号选择)
1×or5×
0.4μLor2μL
TaqDNApolymerase(5U/μL)
1U
0.2μL
RTproduct
2μL
RNase-freeH2O
To20μL
2
3.实时定量PCR反应程序A:一步法扩增(推荐)
95℃3min,1×循环;95℃12s,62℃40s,40×循环,采集荧光信号B:两步法扩增(可选*)
95℃3min,1×循环;95℃12s,62℃30s,72℃30s,40×循环,采集荧光信号注*:用户可根据具体需求选择扩增反应程序,操作步骤参考本公司荧光定量检测试剂盒。
三、数据计算
1.进行荧光定量PCR反应来得到每个反应的目标基因和内参基因的Ct值。
2.计算样品和校正样品三复孔的平均值。
3.目标基因的平均Ct值减去内参基因的平均Ct值,计算各个样品的ΔCt值。
ΔCt(试验样品)=Ct(试验样品目的基因)–Ct(试验样品内参基因)ΔCt(校正样品)=Ct(校正样品目的基因)–Ct(校正样品内参基因)
4.试验样品的ΔCt值减去校正样品的ΔCT值,计算得到各个样品的ΔΔCT值。ΔΔCt(样品)=ΔCt(试验样品)?ΔCt(校正样品)
5.利用2–ΔΔCt计算相对基因表达比率,参考文献[3,4]
四、注意事项(使用前请详细阅读)
1.本说明书操作步骤及反应体系均在本公司实验条件下研发,如使用其他公司产品,请以其说明书为准。
2.由于本公司设计的miRNA是特异性茎环结构引物,如果使用miRNA引物套装时,逆转录一定要使用设计对应的特异逆转录引物(RTPrimer),若使用其他逆转录引物,引物效果将无法保障。miRNA引物套装不适用通用逆转录引物如randomprimer、oligodT等产物扩增检测。
3.本说明书中
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