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PCR技术应用一:诊断单基因疾病
自1987年秋以来,PCR技术的应用开创性地推动了产前单基因缺陷者及携带者的诊断。
目前PCR还不能用于诊断所有已知缺陷疾病,但极大地扩大了实验诊断学家对诊断方法的
选择。JohnHopkins大学的研究人员表明,在诊断基因缺陷疾病方面PCR技术具有快速、
准确、操作灵活等特点。每项进展的实例在以后描述。在1987年10月前,我们用Southern
印迹法产前诊断镰刀红细胞贫血症通常需要两周或更长时间,而1987年10月以后,应用
PCR只需2-4天。在1987年以前,几乎所有的β-地中海贫血症的产前诊断都是通过检测
在β-珠蛋白簇中连锁DNA的多态间接完成的,一般需要2-4周。1987年10月以后,用
PCR扩增β-珠蛋白基因区后,直接检测致病突变即可完成β-地中海贫血症的产前诊断。
这个方法既增加了准确性,又缩短了时间,一般只需一周时间。该项改进技术的作用,(1)
如果我们不能确定在父母双方中β-地中海贫血的突变位置,我们还可以在1、2天之内研
究β-珠蛋白基因簇中DNA的多态性;(2)通过比较母亲与胎儿DNA序列差别来判断
母亲传染的程度。这只是说明PCR对基因诊断意味着什么的几个例子。以下我们举几个特
例具体说明PCR技术的应用:(1)通过扩增产物的打点杂交或限制性内切酶酶解方法确
定已知的点突变;(2)通过对扩增产物直接测序来发现已知或未知的突变;(3)通过改
变PCR扩增产物的大小或产物不能特异扩增来发现异常缺失;(4)通过对DNA多态性
研究来间接诊断致病突变。最后,还将讨论PCR技术的技术性难点、重要控制条件及局限
性。
产前基因诊断基础知识
产前基因诊断是逐步发展起来的,而且在不断完善。1978年Kan和Dozy提出应用与
β-蛋白基因连锁的DNA多态性来间接诊断镰状红细胞贫血。此种诊断需要进行家族性研
究,以确定父母双方的多态性等位基因类型,此等位基因型是用正常β-珠蛋白基因及镰
状红胞β-珠蛋白基因探知的。家族被调查成员包括夫妇俩的孩子,如没有孩子,则调查
夫妇双方的父母。到1982年,通过利用MstⅡ限制性内切酶方法可以直接产前诊断是否有
镰状红细胞贫血,因为内切酶MstⅡ及其同功酶Cv嗷蛳xnNⅠ不能在突变位点降解镰状β
-珠蛋白基因而可在此位点降解正常βA-珠蛋白基因。这种改进不需家族调查,就可更准
确地进行镰状贫血病的产前诊断。正是这种改进法,使直接而简便地确定致病突变成为可能,
这也是我们在所有基因诊断研究中所力求的。
单基因缺陷的诊断是通过对连锁DNA多态性研究及家族研究而确定的。到1988年底,
我们利用这种方法诊断了一些患Duchenne肌营养不良症病人、大多数甲型和乙型血友病
人、所有囊性纤维变性病人及Huntington氏病、神经性纤维瘤和成人多囊肾病人。应用这
种技术同时直接发现了镰状红细胞贫血、β-地中海贫血、α地中海贫血有大多数Duchenne
肌营不良症、部分甲型血友病和成视网膜细胞瘤病人的致病突变。几乎所有这些病例中,由
于重要的DNA序列是已知的,所以PCR技术在产前诊断、症发前诊断及携带者发现等方
面具有非常重要的价值。
应用PCR技术直接发现点突变
在点突变诊断中,继PCR技术之后可用三种技术一打点杂交、酶切分析及直接测序。
JohnHopkins大学研究人员应用以下几步来诊断镰状红细胞贫血:(1)将人绒毛膜样品
(CVS)或羊水中得到的胚细胞在2MNaCl,0.1NNaOH溶液中煮沸。(2)应用PCR技术
在β珠蛋白基因5末端扩增一个725bp区,用30个循环,72℃链延伸120。(3)用CvnI
酶消化725bp扩增产物。(4)降解的产物进行电泳。(5)EB染色。(6)紫外灯下观察
DNA片段,并拍照。
在反应中选择使扩增产物含有两固定CvnI位点的引物。因此,酶解产物至少应可见三
条带。每个镰状红细胞的β珠蛋白基因含有一个381bp带,而正常βA珠蛋白基因经酶结
果已积累了大量信息,所以我们倾向选用限制性内切酶法消化经PCR扩增的产物,而不是
利用特异寡核苷酸探针经打点杂交来诊断βS突变位置的β突变位置。然而,这种方法的的
局限性(也是Souther
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