《生物信息学》课程教学大纲.docx

《生物信息学》教学大纲

课程编号英文名称：Bioinformatics

学分：2

学时：总学时32学时，其中理论32学时，实践0学时

先修课程：生物化学、分子生物学、大学计算机基础

课程类别：专业主干课程

授课对象：生物科学专业学生

教学单位：生命科学学院

修读学期：第5学期

一、课程描述和目标

生物信息学是一门新型交叉应用性学科，是现代生物学研究的重要工具。生物信息学方面的理论基础和基本技能学习，培养学生信息科学、计算机科学和生物学等多学科知识交叉综合运用的能力，掌握运用生物信息学理论、方法和技术初步解决科研和实际工作中生物信息的存储、检索、分析和利用的问题。

课程目标1：专业知识方面，通过本课程的学习，使学生掌握生物信息学的基本概念和基本原理；理解各种生物信息学数据库、软件工具的工作原理。

课程目标2：专业能力方面，使学生掌握常用生物信息学数据库、软件的使用方法，具备生物信息收集、分析、挖掘、利用等方面的基本能力，培养学生信息科学、计算机科学和生物学等多学科知识交叉综合运用的能力。

课程目标3：专业素养方面，具备良好的生物信息学拓展和学习思维能力，具备一定的解决生物信息学复杂问题的能力。

二、课程目标对毕业要求的支撑关系

毕业要求指标点

课程目标

权重

5.1学习想象：具备运用理科相关课程的知识与技能，对复杂生命科学问题进行理解与表达，并提出新观点、新设想和新见解的能力。

课程目标1

课程目标2

H

6.3专业能力：掌握资料查询、文献检索及应用现代信息技术获取专业知识终身学习的能力。

课程目标1

L

9.2语言基础：具备一定的语言能力，能够用恰当的口头和书面表达方式，与社会公众及同行进行有效的沟通。

课程目标1

课程目标2

课程目标3

M

（注：要求课程目标与毕业要求指标点应是一一对应支撑）

三、教学内容、基本要求与学时分配

序号

教学内容

基本要求及重、难点（含德育要求）

学时

教学

方式

对应课程

目标

1

生物信息学学科发展历史、生物信息学研究领域与内容

理解和掌握生物信息学的研究内容

2

集中讲授

课程目标1

2

序列比对的概念、序列比对打分方法和算法、多序列比对、序列比对、进化分析的常用软件及数据有哪些信誉好的足球投注网站

理解和掌握序列比对的方法和进化树的构建方法

7

集中讲授课堂操作

课程目标1、2、3

3

生物数据库及其检索利用，包括核苷酸数据库、蛋白质数据库、结构和药物数据库、数据库数据的提交

理解和掌握各类生物数据库的基本内容和检索方法

6

集中讲授课堂操作

课程目标1、2、3

4

核酸序列的注释分析包括核酸序列的结构、信号检索分析、基因的功能注释、

PCR引物的设计

掌握原核和真核生物核酸序列的注释分析方法

7

集中讲授课堂操作

课程目标1、2、3

5

蛋白质序列分析和结构预测包括蛋白质序列理化性质分析、蛋白质的结构域预测和结构同源建模、蛋白质的药物分子设计

掌握蛋白质序列分析和结构预测分析的原理和方法

6

集中讲授课堂操作

课程目标1、2、3

6

转录组学、基因组学和蛋白组学概述

了解转录组学、基因组学和蛋白组学的技术概况及应用

4

集中讲授

课程目标1、3

合计

32

四、课程教学方法

集中讲授、小组讨论

五、学业评价和课程考核

（一）考核方式及具体要求

1.课程成绩构成与要求

课程考核注重形成性和终结性评价相结合，考核内容主要由平时作业、章节测试、期末考核组成，均按百分制计分，其中期末考核成绩占50%、平时作业成绩占30%、章节测试成绩占20%。

2.课程目标达成考核与评价

序号

教学环节

课程目标1（分值）

课程目标2（分值）

课程目标3（分值）

合计

1

平时作业

5

15

10

30

2

章节测试

5

10

5

20

3

期末考试

10

25

15

50

课程目标对应分值

20

40

40

100

（二）考核与评价标准

1.平时成绩考核与评价标准

分值

观测点

90-100分

70-89分

60-69分

0-59分

作业

按时完成，90%以上的作业内容齐全，在系统掌握生物信息学理论的基础上，熟练运用生物信息学网站和软件开展数据的检索、储存、分析和利用，提练、解决数据中的生物科学问题。

按时完成，70%以上的作业内容齐全，在掌握生物信息学理论的基础上，运用生物信息学网站和软件开展数据的检索、储存、分析和利用，提练、解决数据中的生物科学问题。

延时完成，60%以上的作业内容齐全，在基本掌握生物信息学理论的基础上，能初步运用生物信息学网站和软件开展数据的检索、储存、分析和利用，部分提练、解决数据中的生物科学问题。

不交和补交，50%以下的作业内容齐全，不能较好掌握生物信息学理论，无法准确运用生物信息学网站和软件开展数据的检索、储存、分析和利用，不能提练、解决数据中的生物科学问