引物套装(染料法)说明书.docxVIP

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引物套装(染料法)操作说明

一、试剂组成及配制

试剂

纯化方式

净含量

溶液配制

RTPrimer(特异性逆转录引物)

PAGE

粉剂1nmol×1支

在管中加入100μLRNase-freeH2O配制成10μM储存液

PCRPrimerset(PCR引物对)

PAGE

粉剂2nmol×1支

在管中加入200μLRNase-freeH2O配制成10μM储存液

RNase-freeH2O(去RNA酶水)

液体1.5mL×1支

备注:

干粉剂溶解前,10000r/min,离心15~30s,将干粉离心于管底。引物溶液4℃短期储存,长期保存置于-20℃,可保存6个月。

二、操作步骤

1.基因特异性逆转录反应体系的制备

A在无RNase的离心管中混合下列试剂进行预变性

试剂

终浓度

加量/孔

RTprimer(1μM)

60nM

1.2μL

RNASample

1μg

2μL

B加热70℃,5min后,马上置于冰盒上*

C按照下表提供的20μL逆转录反应体系混合其他试剂

试剂

终浓度

加量/孔

5×MMLVRTBuffer

4μL

dNTP(10mM)

0.375mM

0.75μL

RNasin(40U/μL)(可选*)

0.5U/μL

0.25μL

MMLVReverseTranscriptase(200U/μL)

40U

0.2μL

RNase-freeH2O

To20μL

D运行mRNA逆转录程序:42℃45min,85℃5min,4℃保存

运行miRNA逆转录程序:26℃40min,42℃40min,85℃10min,4℃保存注*:根据用户具体需求,步骤B可选择省略;RNasin为非必需试剂,请客户自备。

2.染料法定量PCR20μL反应加样量体系[1,2]

试剂

终浓度

加量/孔

2×Real-timePCRMasterMix(SYBR)

10μL

PCRPrimerset(10μM)

0.2μM

0.4μL

ROXreferencedye(50×)(依据机器型号选择*)

1×or5×

0.4μLor2μL

TaqDNApolymerase(5U/μL)

1U

0.2μL

RTproduct

2μL

RNase-freeH2O

To20μL

2

3.实时定量PCR反应程序A:一步法扩增(推荐)

95℃3min,1×循环;95℃12s,62℃40s,40×循环,采集荧光信号B:两步法扩增(可选*)

95℃3min,1×循环;95℃12s,62℃30s,72℃30s,40×循环,采集荧光信号注*:用户可根据具体需求选择扩增反应程序,操作步骤参考本公司荧光定量检测试剂盒。

三、数据计算

1.进行荧光定量PCR反应得到每个反应的目标基因和内参基因的Ct值。

2.计算样品和校正样品三复孔的平均值。

3.目标基因的平均Ct值减去内参基因的平均Ct值,计算各个样品的ΔCt值。

ΔCt(试验样品)=Ct(试验样品目的基因)–Ct(试验样品内参基因)ΔCt(校正样品)=Ct(校正样品目的基因)–Ct(校正样品内参基因)

4.试验样品的ΔCt值减去校正样品的ΔCT值,计算得到各个样品的ΔΔCT值。

ΔΔCt(样品)=ΔCt(试验样品)?ΔCt(校正样品)

5.利用2–ΔΔCt计算相对基因表达比率,参考文献[3,4]

四、注意事项(使用前请详细阅读)

1.本说明书操作步骤及反应体系均在本公司实验条件下研发,如使用其他公司产品,请以其说明书为准。

2.由于本公司设计的miRNA是特异性茎环结构引物,如果使用miRNA引物套装时,逆转录一定要使用设计对应的特异逆转录引物(RTPrimer),若使用其他逆转录引物,引物效果将无法保障。miRNA引物套装不适用通用逆转录引物如randomprimer、oligodT等产物扩增检测。

3.本说明书中PCRPrimerset终浓度0.2μM为推荐浓度,可在0.1-0.5μM范围内调整。

4.建议退火温度(62℃)及反应程序,可根据仪器设备、反应试剂等实际情况适当优化。

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