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基因检测与疾病遗传风险评估
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肖自力崔春黎贺宪民张群
1上海荣健生物技术有限公司副总经理2上海同济大学附属同济医院内科副主任医师3上海主健生物工
程有限公司技术总监4上海主健生物工程有限公司技术员
【摘要】本文通过对国内外分子流行病学研究成果的综述,系统阐述了基因检测与疾病遗传风险的关系,并
从具体案例的分析提出如何实施个性化健康管理:个性化保健(老年性痴呆症)、个性化用药(氨基糖苷药物)、
个性化预防(神经管畸形患儿与妊高症)、个性化体检(胃癌、肝癌)、及采取个性化生活方式等。
一基因、基因多态性及遗传病
人们对生命传承的本质探索由来已久,从孟德尔的三大定律,到沃森、克里克的双螺旋结构,研究领域从宏
观逐渐深入微观。随着认识的深入,关于遗传基础的争论,“种质论”终究被科学的“基因学说”代替。如今,
我们已经清楚的了解:作为生物遗传、变异的结构和功能的基本单位,基因,记录、传递着遗传信息,编码着生
命,是生物体生、长、老、病、死等生命现象的内在动力。每个人的健康都和他们携带的基因息息相关,可以说,
除了外伤,所有的疾病都和基因存在着千丝万缕的联系。
在认识基因的前提下,为了在分子层次揭示生命奥秘,一系列宏大计划相继进行,1990年启动的人类基因
组计划(HGP),2002年开始的国际人类基因组单体型图计划(HapMap计划)都是典型代表。这些研究显示:人类
全基因组由30亿个碱基对组成,存在着约3万个左右功能基因,HapMap计划更是揭示了各人种中频率超过5%
的单体型[1,2]。如今,在以功能研究为目标的后基因组时代,科研工作的着眼点仍是基因,只是它更倾向于整体
以及相互联系。
这些研究都是站在全人类的高度,从群体的角度研究基因。如果从个体的角度,我们思考问题:为什么每个
人总体上都长的很相似?因为人与人基因组序列30亿个碱基对有99.9%是相同的;那为什么每个人身高、体重、
性格、疾病易感性等各有不同?那是因为剩下的0.1%的差异造成。这些不同大部分是单个碱基的差别,我们称
之为单核苷酸多态性(singlenucleotidepolymorphism,SNP),这些差异造成了基因多态性,即从群体看,在一
个基因座上存在很多基因类型,而每一个体基因型只能属于该基因的一种类型。
SNP作为基因多态性的最主要的形式,反映了个体与个体间的差异本质。那么运用到人们最关心的健康领域,
它决定了个体与个体间疾病易感性的差异。由此,在人群中通过SNP与疾病罹患情况的关联分析可以确定某一疾
病的危险型SNP;把结果运用到个体,通过检测SNP类型可以对个体患该疾病的风险进行评估。
使用基因检测去评估疾病风险只在具有遗传基础的疾病才有可操作性。遗传病是由遗传物质(包括染色体和
基因)发生异常改变而引起的疾病。根据所涉及遗传物质的改变程序,可将遗传病分为五大类:染色体病(如唐
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氏综合征、猫叫综合征等)、线粒体遗传病(如药物性耳聋)、体细胞遗传病(如肿瘤)、单基因病(如白化病、
血友病等)、单基因遗传病和多基因病。
大多数遗传性疾病是跟多基因、多位点的相联系的疾病。如心脑血管病、肿瘤、骨骼疾病、肥胖、中风、心
脏病、抑郁症、哮喘、糖尿病等。多基因病的主要特点:(1)一种疾病由多个基因、多个位点参与,而一个基因
位点可能与多个疾病有关。(2)遗传决定的不是疾病本身,而是这种疾病的遗传易感性(即基因型遵循遗传三大
定律,但表型不一定遵循遗传三大定律);(3)疾病发生受外因(生活习惯、生活方式、生活环境、心理因素等)
的影响,发病机制十分复杂。总之,多基因病是内因(基因)与外因共同作用的结果。
二基因(SNP)检测与疾病遗传风险评估
目前,很多研究机构进行遗传背景和疾病发生关系的研究,认识了很多疾病风险相关SNP,建立起各种疾病
遗传风险评估模型,用于评估个体疾病的发病风险。风险评估的意义在于趋利避害,用于进行个性化健康管理:
个性化保健、个性化用药、个性化预防、个性化体检及采取个性化的行为生活方式等,最终达到
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