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ICS65.020.01B05
备案号:56324-2017DB22吉林省地方标准
DB22/T2623.3—2017
黑木耳菌种区别性及真实性鉴定第3部分:SRAP法
VerificationofdistinctnessandgenuinenessforBlackwoodearspawn
Part3:SRAP
2017-06-12发布2017-08-12实施
吉林省质量技术监督局发布
I
DB22/T2623.3—2017
前言
《黑木耳菌种区别性及真实性鉴定》分为以下3个部分:
——DB22/T2623.1黑木耳菌种区别性及真实性鉴定第1部分对峙培养法
——DB22/T2623.2黑木耳菌种区别性及真实性鉴定第2部分酯酶同工酶法——DB22/T2623.3黑木耳菌种区别性及真实性鉴定第3部分SRAP法
本部分为第3部分:SRAP法。
本标准按照GB/T1.1—2009和GB/T20001.4—2015给出的规则起草。本标准由吉林省农业委员会提出并归口。
本标准起草单位:吉林农业大学、吉林省海外农业投资开发集团有限公司。
本标准主要起草人:姚方杰、张友民、方明、陈影、鲁丽鑫、王鹏、姚允武、于娅、刘宏宇、李丹、王晓娥、陈艳秋、刘迪、张伟彤、孔祥会、马晓旭、张媛媛、李玉。
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DB22/T2623.3—2017
黑木耳菌种区别性及真实性鉴定第3部分:SRAP法
1范围
本标准规定了黑木耳菌种真实性SRAP法的原理、试剂和材料、仪器设备、样品、试验步骤、试验数据处理。
本标准适用于黑木耳菌种真实性鉴定。
2术语和定义
下列术语和定义适用于本文件。2.1
引物primer
适用于黑木耳菌株真实性鉴定的一定长度和顺序的寡核苷酸链。2.2
PCR空白对照PCRcontrolcheck
以无菌水作为模板进行PCR反应,以验证PCR反应过程中是否发生污染。2.3
阴性提取对照negativecontrol
水作为材料提取DNA,以证明黑木耳DNA在制备过程中是否发生污染。
3原理
对黑木耳菌种的ORFs区域中内含子、启动子进行特异扩增,检测和比较该序列长度多态性。通过对PCR产物的检测和比较,识别黑木耳菌种基因组DNA的多态片段,鉴定菌种的真实性。
4试剂和材料
4.1培养基:见附录A。
4.2四种脱氧核糖核苷酸(dATP,dCTP,dGTP,dTTP)混合溶液。4.3TaqDNA聚合酶。
4.4核酸染料。
4.5DNA分子量标记。
4.6引物:参见附录C。
4.7剥离硅烷。4.8亲和硅烷。
4.91mol/LTris-HCl(pH8.0):见附录B.1。
4.100.5mol/L乙二胺四乙酸二钠盐(EDTA-2Na)溶液:见附录B.2。
4.11CTAB提取缓冲液:见附录B.3。
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DB22/T2623.3—2017
4.12CTAB纯化缓冲液:见附录B.4。
4.13氯仿异戊醇(24:1):见附录B.5。
4.14酚-氯仿异戊醇(25:24:1):见附录B.6。
4.1570%乙醇溶液:见附录B.7。
4.1630%丙烯酰胺溶液:见附录B.8。
4.1710%过硫酸铵:见附录B.9。
4.188%聚丙烯酰胺凝胶溶液:见附录B.10。
4.195×TBE缓冲液:见附录B.11。
4.201×TBE缓冲液:见附录B.12。
4.210.1%硝酸银(AgNO3)溶液:见附录B.13。
4.22显影液:见附录B.14。
4.23液氮。
5仪器设备
5.1PCR扩增仪。
5.2高速冷冻离心机(10000rpm以上)。5.3紫外分光光度计。
5.4全温摇瓶柜:精度±0.1℃。5.5凝胶成像系统。
5.6电热恒温水浴槽:精度±0.1℃。5.7垂直板电泳槽。
5.8稳压稳流电泳仪。
5.9分析天平:感量0.01g、0.0001g各一台。
6样品
6.1菌丝体培养
直接将接种块接入三角瓶液体培养基中,25℃,120rpm振荡避光培养20d。培养基的制备参见附录A。
6.2DNA样品提取
6.2.1菌丝培养量以可做3次平行试验为准,固体
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