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PCR的应用
随着生物技术的飞速发展,曾经遥不可及的PCR技术逐步走进了高中实验室。PCR技
术应用广泛,如实时荧光定量RT-PCR技术、重叠延伸PCR、大引物PCR、反向PCR、巢
式PCR等,高考试题中有关PCR的问题越来越多,设问考查深度也明显提升。各种PCR技
术不是孤立的,它们均以常规PCR为基础,为实现特定目的而进行了一定改进,但也有各自
的局限性,因此在必要时可同时使用几种扩增技术,如多重巢式PCR、反向实时荧光定量PCR
等。
在高考备考中,要关注不同扩增技术的本质差异,同时总结此类试题的解答步骤:一是
寻找题图有效信息,确定所考PCR类型;二是迅速再忆所考PCR的独特性,猜测出题人可
能的意图;三是根据设问对前述猜测进行验证,并领悟出题人挖掘的新考点,进而对知识框
架进行完善。
1.实时荧光定量RT-PCR技术检测病毒核酸
病毒感染的常规检测方法是通过实时荧光PCR鉴定。实时荧光PCR扩增目的基因,需额外
添加荧光标记探针(一小段单链DNA,可与目的基因中部序列特异性结合)。当探针完整时,
不产生荧光。在PCR过程中,与目的基因结合的探针被耐高温的DNA聚合酶水解,R与Q
分离后,R发出的荧光可被检测到(如图甲),通过实时荧光PCR检测某冠状病毒感染时,检
测到的荧光强度变化如图乙,荧光到达预先设定阈值的循环数(Ct值)越小,说明病毒核酸浓
度越高。
2.PCR定点突变——重叠延伸PCR技术
重叠延伸PCR技术其主要设计思路是用具有互补配对片段的引物(图中的引物2和3,突起处
代表与模板链不能互补的突变位点),分别进行PCR,获得有重叠链的两种DNA片段,再在
随后的扩增反应中通过重叠链的延伸获得想要的目的基因。如某科研团队运用重叠延伸PCR
技术在水蛭素基因中的特定位点引入特定突变,使水蛭素第47位的天冬酰胺(密码子为AAC、
AAU)替换为赖氨酸(密码子为AAA、AAG),从而提高水蛭素的抗凝血活性。原理如图:
3.PCR定点突变——大引物PCR技术
大引物PCR需要用到三条引物进行两轮PCR,这三条引物分别是突变上游引物、常规上游
引物和常规下游引物。第一轮PCR利用突变上游引物和常规下游引物进行扩增,得到不完整
的含有突变位点的DNA片段;第二轮PCR利用第一轮扩增产物中的一条DNA链作为下游
大引物,它与常规上游引物一起扩增得到完整的含有突变位点的DNA片段。原理如图。
4.反向PCR扩增已知序列两侧的未知序列
当DNA的某些序列已知,而需要扩增已知序列两端的未知序列时,可采用反向PCR技术。
原理是:用限制酶消化该DNA,随后使用DNA连接酶将获得的酶切产物环化,这样就获得
了已知序列两侧携带有未知序列的环状DNA分子。以该已知序列为模板设计一对相反方向
的特异性引物,该引物对已知序列反向,但对未知序列却是相向的,从而得以扩增出未知序
列。原理如图。
5.巢式PCR
首先将目标的DNA模板与第一套引物(外引物)结合。第一套引物也可能结合到其他具有相似
结合位点的片段上并扩增多种产物。但只有一种产物是目的片段(图中未显示可能的多种产
物)。然后使用第二套引物(内引物)对第一轮PCR扩增的产物进行第二轮PCR扩增。由于第
二套引物位于第一轮PCR产物内部,而非目的片段包含两套引物结合位点的可能性极小,因
此第二套引物不可能扩增非目的片段。这种巢式PCR扩增确保第二轮PCR产物几乎或者完
全没有引物配对特异性不强造成的非特异性扩增的污染。原理如图。
1.(2023兰州高三质检·)实时荧光RT-PCR可用于RNA病毒的核酸检测,其原理是:在PCR
复性过程中探针和引物一起与模板结合,探针两侧分别带有荧光基团和抑制荧光发出的淬灭
基团,新链延伸过程中,DNA聚合酶会破坏探针,导致荧光基团与淬灭基团分离而发出荧光。
利用RT-PCR进行核酸检测的相关过程如图所示。下列说法错误的是()
A.做RT-PCR之前,需要先根据cDNA的核苷酸序列合成引物和探针
B.RNA不能作为PCR扩增的模板,故需要将样本中的RNA反转录为cDNA后再进行扩
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